Protein–RNA interactions for Protein: O14787

TNPO2, Transportin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO2O14787 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNPO2O14787 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNPO2O14787 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TNPO2O14787 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNPO2O14787 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNPO2O14787 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNPO2O14787 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNPO2O14787 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNPO2O14787 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNPO2O14787 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNPO2O14787 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNPO2O14787 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNPO2O14787 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNPO2O14787 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNPO2O14787 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNPO2O14787 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNPO2O14787 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNPO2O14787 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TNPO2O14787 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNPO2O14787 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNPO2O14787 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNPO2O14787 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNPO2O14787 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNPO2O14787 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TNPO2O14787 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNPO2O14787 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNPO2O14787 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNPO2O14787 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNPO2O14787 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TNPO2O14787 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNPO2O14787 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TNPO2O14787 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNPO2O14787 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TNPO2O14787 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNPO2O14787 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms