Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
BHLHE40O14503 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
BHLHE40O14503 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms