Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGRNO00468 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGRNO00468 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGRNO00468 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGRNO00468 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGRNO00468 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
AGRNO00468 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGRNO00468 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGRNO00468 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGRNO00468 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGRNO00468 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGRNO00468 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGRNO00468 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGRNO00468 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGRNO00468 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
AGRNO00468 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGRNO00468 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGRNO00468 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGRNO00468 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGRNO00468 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGRNO00468 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGRNO00468 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGRNO00468 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGRNO00468 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
AGRNO00468 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGRNO00468 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGRNO00468 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGRNO00468 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGRNO00468 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGRNO00468 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGRNO00468 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGRNO00468 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGRNO00468 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGRNO00468 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGRNO00468 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGRNO00468 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGRNO00468 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGRNO00468 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGRNO00468 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGRNO00468 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGRNO00468 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGRNO00468 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGRNO00468 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGRNO00468 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGRNO00468 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGRNO00468 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGRNO00468 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
AGRNO00468 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGRNO00468 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGRNO00468 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGRNO00468 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGRNO00468 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
AGRNO00468 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGRNO00468 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGRNO00468 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
AGRNO00468 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
AGRNO00468 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
AGRNO00468 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
AGRNO00468 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
AGRNO00468 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
AGRNO00468 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
AGRNO00468 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
AGRNO00468 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
AGRNO00468 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AGRNO00468 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AGRNO00468 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AGRNO00468 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AGRNO00468 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AGRNO00468 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AGRNO00468 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AGRNO00468 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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AGRNO00468 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AGRNO00468 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AGRNO00468 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AGRNO00468 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AGRNO00468 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AGRNO00468 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
AGRNO00468 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AGRNO00468 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
AGRNO00468 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AGRNO00468 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AGRNO00468 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AGRNO00468 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AGRNO00468 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AGRNO00468 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AGRNO00468 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
AGRNO00468 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AGRNO00468 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AGRNO00468 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AGRNO00468 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
AGRNO00468 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AGRNO00468 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AGRNO00468 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AGRNO00468 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AGRNO00468 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AGRNO00468 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
AGRNO00468 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AGRNO00468 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
AGRNO00468 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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