Protein–RNA interactions for Protein: H3BQV1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQV1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BQV1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BQV1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BQV1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BQV1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BQV1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BQV1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BQV1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BQV1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BQV1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BQV1 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BQV1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BQV1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BQV1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BQV1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BQV1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BQV1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BQV1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BQV1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BQV1 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BQV1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BQV1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BQV1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3BQV1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3BQV1 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3BQV1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3BQV1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3BQV1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3BQV1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
H3BQV1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3BQV1 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3BQV1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3BQV1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3BQV1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3BQV1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3BQV1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3BQV1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3BQV1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3BQV1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3BQV1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BQV1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BQV1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BQV1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BQV1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BQV1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BQV1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BQV1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BQV1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BQV1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BQV1 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BQV1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BQV1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BQV1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BQV1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BQV1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BQV1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BQV1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BQV1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BQV1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BQV1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BQV1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BQV1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BQV1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BQV1 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BQV1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BQV1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BQV1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BQV1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BQV1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BQV1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BQV1 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BQV1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BQV1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BQV1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BQV1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BQV1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BQV1 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BQV1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BQV1 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BQV1 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BQV1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BQV1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BQV1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BQV1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BQV1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BQV1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BQV1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BQV1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BQV1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BQV1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BQV1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BQV1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BQV1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BQV1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BQV1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BQV1 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BQV1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BQV1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BQV1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BQV1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms