Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NPIPB9F8W1W9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NPIPB9F8W1W9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms