Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP17L12C9JPN9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP17L12C9JPN9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms