Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
KNCNA6PVL3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KNCNA6PVL3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KNCNA6PVL3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KNCNA6PVL3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KNCNA6PVL3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KNCNA6PVL3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KNCNA6PVL3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KNCNA6PVL3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KNCNA6PVL3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KNCNA6PVL3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
KNCNA6PVL3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KNCNA6PVL3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KNCNA6PVL3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KNCNA6PVL3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KNCNA6PVL3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KNCNA6PVL3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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