Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTLL13PA6NNM8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TTLL13PA6NNM8 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms