Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HELTA6NFD8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms