Protein–RNA interactions for Protein: A2RUT3

TMEM89, Transmembrane protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM89A2RUT3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TMEM89A2RUT3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM89A2RUT3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms