Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDGFL3Q9Y3E1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDGFL3Q9Y3E1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDGFL3Q9Y3E1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDGFL3Q9Y3E1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDGFL3Q9Y3E1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDGFL3Q9Y3E1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDGFL3Q9Y3E1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDGFL3Q9Y3E1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDGFL3Q9Y3E1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDGFL3Q9Y3E1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDGFL3Q9Y3E1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDGFL3Q9Y3E1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDGFL3Q9Y3E1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDGFL3Q9Y3E1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDGFL3Q9Y3E1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HDGFL3Q9Y3E1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDGFL3Q9Y3E1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDGFL3Q9Y3E1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDGFL3Q9Y3E1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDGFL3Q9Y3E1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HDGFL3Q9Y3E1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HDGFL3Q9Y3E1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDGFL3Q9Y3E1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDGFL3Q9Y3E1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDGFL3Q9Y3E1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDGFL3Q9Y3E1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HDGFL3Q9Y3E1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDGFL3Q9Y3E1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDGFL3Q9Y3E1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDGFL3Q9Y3E1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HDGFL3Q9Y3E1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDGFL3Q9Y3E1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HDGFL3Q9Y3E1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDGFL3Q9Y3E1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDGFL3Q9Y3E1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDGFL3Q9Y3E1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDGFL3Q9Y3E1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDGFL3Q9Y3E1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HDGFL3Q9Y3E1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDGFL3Q9Y3E1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDGFL3Q9Y3E1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDGFL3Q9Y3E1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HDGFL3Q9Y3E1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDGFL3Q9Y3E1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDGFL3Q9Y3E1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDGFL3Q9Y3E1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HDGFL3Q9Y3E1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HDGFL3Q9Y3E1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HDGFL3Q9Y3E1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDGFL3Q9Y3E1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDGFL3Q9Y3E1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HDGFL3Q9Y3E1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HDGFL3Q9Y3E1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDGFL3Q9Y3E1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDGFL3Q9Y3E1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDGFL3Q9Y3E1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDGFL3Q9Y3E1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDGFL3Q9Y3E1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDGFL3Q9Y3E1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDGFL3Q9Y3E1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDGFL3Q9Y3E1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDGFL3Q9Y3E1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDGFL3Q9Y3E1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDGFL3Q9Y3E1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDGFL3Q9Y3E1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDGFL3Q9Y3E1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDGFL3Q9Y3E1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDGFL3Q9Y3E1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDGFL3Q9Y3E1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDGFL3Q9Y3E1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDGFL3Q9Y3E1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HDGFL3Q9Y3E1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDGFL3Q9Y3E1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDGFL3Q9Y3E1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDGFL3Q9Y3E1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HDGFL3Q9Y3E1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HDGFL3Q9Y3E1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HDGFL3Q9Y3E1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HDGFL3Q9Y3E1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDGFL3Q9Y3E1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDGFL3Q9Y3E1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HDGFL3Q9Y3E1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HDGFL3Q9Y3E1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDGFL3Q9Y3E1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HDGFL3Q9Y3E1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HDGFL3Q9Y3E1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HDGFL3Q9Y3E1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HDGFL3Q9Y3E1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HDGFL3Q9Y3E1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HDGFL3Q9Y3E1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HDGFL3Q9Y3E1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HDGFL3Q9Y3E1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HDGFL3Q9Y3E1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HDGFL3Q9Y3E1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms