Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2R4

DDX52, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX52, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX52Q9Y2R4 EHMT1-202ENST00000460486 818 ntTSL 520.48■□□□□ 0.877e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 CLN6-218ENST00000637223 652 ntTSL 520.41■□□□□ 0.867e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.867e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.817e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 EHMT1-219ENST00000626066 1297 ntTSL 520.08■□□□□ 0.817e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 AKT1-204ENST00000544168 1564 ntTSL 220.03■□□□□ 0.87e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 MXD4-202ENST00000510822 561 ntTSL 319.94■□□□□ 0.787e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 CLN6-208ENST00000567060 945 ntTSL 219.79■□□□□ 0.767e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.757e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 PRPSAP1-202ENST00000423915 549 ntTSL 419.64■□□□□ 0.737e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 GIPR-207ENST00000591322 557 ntTSL 419.62■□□□□ 0.737e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 AC107871.1-203ENST00000637054 3238 ntTSL 519.42■□□□□ 0.77e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.77e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.667e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 AC107871.1-201ENST00000637888 2941 ntTSL 519.12■□□□□ 0.657e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.654e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 SERINC2-204ENST00000491976 2807 ntTSL 218.99■□□□□ 0.637e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.637e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.627e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.67e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 ZNF518B-205ENST00000515072 2623 ntTSL 1 (best)18.56■□□□□ 0.567e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 PCGF3-206ENST00000433814 639 ntTSL 418.43■□□□□ 0.547e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.57e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 JUP-206ENST00000437187 1029 ntTSL 318.18■□□□□ 0.57e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 JUP-205ENST00000424457 949 ntTSL 318.18■□□□□ 0.57e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.496e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.497e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 CLN6-219ENST00000637329 1204 ntTSL 518.09■□□□□ 0.497e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.467e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.467e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 EHMT1-250ENST00000637977 2167 ntTSL 517.87■□□□□ 0.457e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 RNPEPL1-203ENST00000451363 538 ntTSL 417.73■□□□□ 0.437e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.395e-56■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 RNPEPL1-208ENST00000486058 3126 ntTSL 217.47■□□□□ 0.397e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.387e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.387e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.377e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.356e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 GOLGA8A-204ENST00000565885 665 ntTSL 317.19■□□□□ 0.347e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 MXD4-205ENST00000515378 522 ntTSL 217.13■□□□□ 0.337e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 SGTA-202ENST00000586711 571 ntTSL 317.1■□□□□ 0.337e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 RGS20-206ENST00000518286 455 ntTSL 317.06■□□□□ 0.327e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 FAM129B-204ENST00000468379 828 ntTSL 316.93■□□□□ 0.37e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.36e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 AKT1-218ENST00000557552 8396 ntTSL 516.93■□□□□ 0.37e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 EHMT1-251ENST00000638071 1710 ntTSL 516.92■□□□□ 0.37e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 JUP-211ENST00000589036 566 ntTSL 416.75■□□□□ 0.277e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.277e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 FAM129B-206ENST00000478917 362 ntTSL 516.71■□□□□ 0.277e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 SAR1A-203ENST00000373239 468 ntTSL 316.57■□□□□ 0.247e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 CLN6-215ENST00000636674 2005 ntTSL 516.46■□□□□ 0.237e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.27e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 TFDP1-205ENST00000465174 955 ntTSL 316.04■□□□□ 0.167e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.156e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 AKT1-210ENST00000554826 572 ntTSL 315.96■□□□□ 0.157e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.147e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 JUP-209ENST00000465293 432 ntTSL 515.68■□□□□ 0.17e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 SGTA-204ENST00000589251 637 ntTSL 315.61■□□□□ 0.097e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 EEF1D-214ENST00000526135 535 ntTSL 215.34■□□□□ 0.057e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 BMP4-205ENST00000558984 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.037e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 CLN6-225ENST00000638144 576 ntTSL 514.88□□□□□ -0.037e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.037e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 GPC3-201ENST00000370818 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.045e-56■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 MXD4-204ENST00000513380 624 ntTSL 514.68□□□□□ -0.067e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 LINC00106-201ENST00000430235 370 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.087e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 AC087380.1-204ENST00000418729 1026 ntTSL 1 (best)14.43□□□□□ -0.17e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 SEPT9-203ENST00000427177 3821 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.114e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 BMP4-202ENST00000417573 1784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.147e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 SEPT9-207ENST00000449803 3996 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.184e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.187e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 LINC00106-202ENST00000434938 356 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.187e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 CLN6-223ENST00000637823 717 ntTSL 513.87□□□□□ -0.197e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 JUP-207ENST00000437369 586 ntTSL 313.69□□□□□ -0.227e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 EHMT1-221ENST00000629335 3600 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.237e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 JUP-202ENST00000393930 3298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.267e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 SEPT9-206ENST00000431235 4004 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.264e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 CLN6-217ENST00000636964 3335 ntTSL 213.28□□□□□ -0.287e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 SEPT9-201ENST00000329047 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.296e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 SEPT9-205ENST00000427674 3937 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.296e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 SEPT9-235ENST00000591020 582 ntTSL 413.11□□□□□ -0.317e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 JUP-201ENST00000310706 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.337e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.357e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 SLC7A5-203ENST00000565644 3983 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.47e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 KDM6B-204ENST00000571047 362 ntTSL 512.51□□□□□ -0.417e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 HBG2-202ENST00000380252 694 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.417e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 ZNF518B-203ENST00000503068 4196 ntTSL 1 (best)12.35□□□□□ -0.437e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 JUP-203ENST00000393931 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.447e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 HBG2-203ENST00000380259 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.57e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 ZNF518B-204ENST00000507515 527 ntTSL 411.66□□□□□ -0.547e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 CLN6-203ENST00000563917 557 ntTSL 511.27□□□□□ -0.617e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 HBE1-202ENST00000380237 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.647e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 SAR1A-205ENST00000373242 5981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.877e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 RGS20-207ENST00000522225 1559 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.877e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 ZNF518B-202ENST00000500268 4145 ntTSL 1 (best)9.41□□□□□ -0.97e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 GPC3-204ENST00000631057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.947e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 AC087380.1-201ENST00000420465 1001 ntTSL 38.71□□□□□ -1.027e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 AGO1-202ENST00000373206 3996 ntTSL 2 BASIC8.18□□□□□ -1.17e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 AC087380.1-202ENST00000415970 1163 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.267e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 AC087380.1-203ENST00000420726 752 ntTSL 57.11□□□□□ -1.277e-6■■■■■ 33.6
DDX52Q9Y2R4 HBE1-203ENST00000396895 578 ntTSL 56.46□□□□□ -1.387e-6■■■■■ 33.6
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