Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR2

LRP1B, Low-density lipoprotein receptor-related protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 4,599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1BQ9NZR2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRP1BQ9NZR2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRP1BQ9NZR2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRP1BQ9NZR2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRP1BQ9NZR2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LRP1BQ9NZR2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRP1BQ9NZR2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRP1BQ9NZR2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRP1BQ9NZR2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LRP1BQ9NZR2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRP1BQ9NZR2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRP1BQ9NZR2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRP1BQ9NZR2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LRP1BQ9NZR2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRP1BQ9NZR2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LRP1BQ9NZR2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LRP1BQ9NZR2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LRP1BQ9NZR2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LRP1BQ9NZR2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LRP1BQ9NZR2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LRP1BQ9NZR2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LRP1BQ9NZR2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LRP1BQ9NZR2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LRP1BQ9NZR2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LRP1BQ9NZR2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LRP1BQ9NZR2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.26
LRP1BQ9NZR2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LRP1BQ9NZR2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LRP1BQ9NZR2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LRP1BQ9NZR2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRP1BQ9NZR2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LRP1BQ9NZR2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRP1BQ9NZR2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRP1BQ9NZR2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRP1BQ9NZR2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRP1BQ9NZR2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRP1BQ9NZR2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LRP1BQ9NZR2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRP1BQ9NZR2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRP1BQ9NZR2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRP1BQ9NZR2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRP1BQ9NZR2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRP1BQ9NZR2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LRP1BQ9NZR2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRP1BQ9NZR2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRP1BQ9NZR2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LRP1BQ9NZR2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LRP1BQ9NZR2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
LRP1BQ9NZR2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRP1BQ9NZR2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRP1BQ9NZR2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRP1BQ9NZR2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRP1BQ9NZR2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRP1BQ9NZR2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRP1BQ9NZR2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRP1BQ9NZR2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRP1BQ9NZR2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRP1BQ9NZR2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LRP1BQ9NZR2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LRP1BQ9NZR2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRP1BQ9NZR2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRP1BQ9NZR2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRP1BQ9NZR2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRP1BQ9NZR2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRP1BQ9NZR2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRP1BQ9NZR2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRP1BQ9NZR2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRP1BQ9NZR2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRP1BQ9NZR2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRP1BQ9NZR2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRP1BQ9NZR2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LRP1BQ9NZR2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRP1BQ9NZR2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRP1BQ9NZR2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LRP1BQ9NZR2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LRP1BQ9NZR2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRP1BQ9NZR2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRP1BQ9NZR2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LRP1BQ9NZR2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LRP1BQ9NZR2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRP1BQ9NZR2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRP1BQ9NZR2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRP1BQ9NZR2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LRP1BQ9NZR2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRP1BQ9NZR2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRP1BQ9NZR2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRP1BQ9NZR2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRP1BQ9NZR2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRP1BQ9NZR2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRP1BQ9NZR2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LRP1BQ9NZR2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRP1BQ9NZR2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LRP1BQ9NZR2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRP1BQ9NZR2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRP1BQ9NZR2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRP1BQ9NZR2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRP1BQ9NZR2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRP1BQ9NZR2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LRP1BQ9NZR2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LRP1BQ9NZR2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms