Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.27■■■■■ 4.84
PDS5BQ9NTI5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC45.27■■■■■ 4.84
PDS5BQ9NTI5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC45.27■■■■■ 4.84
PDS5BQ9NTI5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC45.27■■■■■ 4.84
PDS5BQ9NTI5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC45.27■■■■■ 4.84
PDS5BQ9NTI5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
PDS5BQ9NTI5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
PDS5BQ9NTI5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
PDS5BQ9NTI5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
PDS5BQ9NTI5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC45.25■■■■■ 4.83
PDS5BQ9NTI5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
PDS5BQ9NTI5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
PDS5BQ9NTI5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC45.22■■■■■ 4.83
PDS5BQ9NTI5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
PDS5BQ9NTI5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
PDS5BQ9NTI5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC45.21■■■■■ 4.83
PDS5BQ9NTI5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
PDS5BQ9NTI5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
PDS5BQ9NTI5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.2■■■■■ 4.83
PDS5BQ9NTI5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC45.2■■■■■ 4.83
PDS5BQ9NTI5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
PDS5BQ9NTI5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC45.18■■■■■ 4.82
PDS5BQ9NTI5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
PDS5BQ9NTI5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
PDS5BQ9NTI5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC45.16■■■■■ 4.82
PDS5BQ9NTI5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
PDS5BQ9NTI5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
PDS5BQ9NTI5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC45.14■■■■■ 4.82
PDS5BQ9NTI5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
PDS5BQ9NTI5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC45.14■■■■■ 4.82
PDS5BQ9NTI5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC45.14■■■■■ 4.82
PDS5BQ9NTI5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC45.13■■■■■ 4.82
PDS5BQ9NTI5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.81
PDS5BQ9NTI5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC45.12■■■■■ 4.81
PDS5BQ9NTI5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
PDS5BQ9NTI5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
PDS5BQ9NTI5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
PDS5BQ9NTI5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
PDS5BQ9NTI5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC45.08■■■■■ 4.81
PDS5BQ9NTI5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC45.08■■■■■ 4.81
PDS5BQ9NTI5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC45.07■■■■■ 4.81
PDS5BQ9NTI5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.81
PDS5BQ9NTI5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC45.07■■■■■ 4.81
PDS5BQ9NTI5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
PDS5BQ9NTI5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
PDS5BQ9NTI5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC45.05■■■■■ 4.8
PDS5BQ9NTI5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
PDS5BQ9NTI5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
PDS5BQ9NTI5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.04■■■■■ 4.8
PDS5BQ9NTI5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.04■■■■■ 4.8
PDS5BQ9NTI5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
PDS5BQ9NTI5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC45.03■■■■■ 4.8
PDS5BQ9NTI5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
PDS5BQ9NTI5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC45.03■■■■■ 4.8
PDS5BQ9NTI5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.02■■■■■ 4.8
PDS5BQ9NTI5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
PDS5BQ9NTI5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC45.01■■■■■ 4.8
PDS5BQ9NTI5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC45■■■■■ 4.79
PDS5BQ9NTI5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC45■■■■■ 4.79
PDS5BQ9NTI5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC44.99■■■■■ 4.79
PDS5BQ9NTI5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
PDS5BQ9NTI5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
PDS5BQ9NTI5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
PDS5BQ9NTI5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
PDS5BQ9NTI5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
PDS5BQ9NTI5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
PDS5BQ9NTI5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
PDS5BQ9NTI5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC44.97■■■■■ 4.79
PDS5BQ9NTI5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC44.96■■■■■ 4.79
PDS5BQ9NTI5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC44.96■■■■■ 4.79
PDS5BQ9NTI5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC44.96■■■■■ 4.79
PDS5BQ9NTI5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.96■■■■■ 4.79
PDS5BQ9NTI5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
PDS5BQ9NTI5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC44.95■■■■■ 4.79
PDS5BQ9NTI5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC44.94■■■■■ 4.79
PDS5BQ9NTI5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC44.94■■■■■ 4.79
PDS5BQ9NTI5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.78
PDS5BQ9NTI5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
PDS5BQ9NTI5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
PDS5BQ9NTI5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC44.91■■■■■ 4.78
PDS5BQ9NTI5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
PDS5BQ9NTI5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC44.91■■■■■ 4.78
PDS5BQ9NTI5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC44.91■■■■■ 4.78
PDS5BQ9NTI5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
PDS5BQ9NTI5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
PDS5BQ9NTI5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
PDS5BQ9NTI5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
PDS5BQ9NTI5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
PDS5BQ9NTI5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
PDS5BQ9NTI5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC44.88■■■■■ 4.78
PDS5BQ9NTI5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
PDS5BQ9NTI5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
PDS5BQ9NTI5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC44.88■■■■■ 4.78
PDS5BQ9NTI5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.88■■■■■ 4.78
PDS5BQ9NTI5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC44.88■■■■■ 4.78
PDS5BQ9NTI5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
PDS5BQ9NTI5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
PDS5BQ9NTI5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44.84■■■■■ 4.77
PDS5BQ9NTI5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
PDS5BQ9NTI5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.83■■■■■ 4.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms