Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPF2

CHST11, Carbohydrate sulfotransferase 11, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST11Q9NPF2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHST11Q9NPF2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHST11Q9NPF2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHST11Q9NPF2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHST11Q9NPF2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHST11Q9NPF2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHST11Q9NPF2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHST11Q9NPF2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHST11Q9NPF2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHST11Q9NPF2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHST11Q9NPF2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHST11Q9NPF2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHST11Q9NPF2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHST11Q9NPF2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHST11Q9NPF2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CHST11Q9NPF2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHST11Q9NPF2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHST11Q9NPF2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHST11Q9NPF2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHST11Q9NPF2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHST11Q9NPF2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHST11Q9NPF2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHST11Q9NPF2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHST11Q9NPF2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHST11Q9NPF2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHST11Q9NPF2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHST11Q9NPF2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHST11Q9NPF2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHST11Q9NPF2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHST11Q9NPF2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHST11Q9NPF2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHST11Q9NPF2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CHST11Q9NPF2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHST11Q9NPF2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CHST11Q9NPF2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHST11Q9NPF2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHST11Q9NPF2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHST11Q9NPF2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHST11Q9NPF2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHST11Q9NPF2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHST11Q9NPF2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHST11Q9NPF2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHST11Q9NPF2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CHST11Q9NPF2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHST11Q9NPF2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHST11Q9NPF2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHST11Q9NPF2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHST11Q9NPF2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CHST11Q9NPF2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CHST11Q9NPF2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CHST11Q9NPF2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHST11Q9NPF2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHST11Q9NPF2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHST11Q9NPF2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CHST11Q9NPF2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHST11Q9NPF2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHST11Q9NPF2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHST11Q9NPF2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHST11Q9NPF2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CHST11Q9NPF2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHST11Q9NPF2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHST11Q9NPF2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CHST11Q9NPF2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHST11Q9NPF2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHST11Q9NPF2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CHST11Q9NPF2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHST11Q9NPF2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CHST11Q9NPF2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHST11Q9NPF2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHST11Q9NPF2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHST11Q9NPF2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHST11Q9NPF2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHST11Q9NPF2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHST11Q9NPF2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHST11Q9NPF2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHST11Q9NPF2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHST11Q9NPF2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHST11Q9NPF2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHST11Q9NPF2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHST11Q9NPF2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHST11Q9NPF2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHST11Q9NPF2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHST11Q9NPF2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHST11Q9NPF2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHST11Q9NPF2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHST11Q9NPF2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHST11Q9NPF2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHST11Q9NPF2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHST11Q9NPF2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHST11Q9NPF2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHST11Q9NPF2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHST11Q9NPF2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHST11Q9NPF2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHST11Q9NPF2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHST11Q9NPF2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHST11Q9NPF2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHST11Q9NPF2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHST11Q9NPF2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHST11Q9NPF2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHST11Q9NPF2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms