Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB60

Fam213b, Prostamide/prostaglandin F synthase, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam213bQ9DB60 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam213bQ9DB60 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fam213bQ9DB60 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam213bQ9DB60 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam213bQ9DB60 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam213bQ9DB60 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam213bQ9DB60 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam213bQ9DB60 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fam213bQ9DB60 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Fam213bQ9DB60 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Fam213bQ9DB60 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Fam213bQ9DB60 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Fam213bQ9DB60 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam213bQ9DB60 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam213bQ9DB60 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam213bQ9DB60 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fam213bQ9DB60 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam213bQ9DB60 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam213bQ9DB60 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam213bQ9DB60 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam213bQ9DB60 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fam213bQ9DB60 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam213bQ9DB60 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam213bQ9DB60 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam213bQ9DB60 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam213bQ9DB60 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fam213bQ9DB60 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam213bQ9DB60 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam213bQ9DB60 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam213bQ9DB60 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam213bQ9DB60 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam213bQ9DB60 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam213bQ9DB60 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam213bQ9DB60 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fam213bQ9DB60 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam213bQ9DB60 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fam213bQ9DB60 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam213bQ9DB60 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam213bQ9DB60 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fam213bQ9DB60 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fam213bQ9DB60 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fam213bQ9DB60 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam213bQ9DB60 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam213bQ9DB60 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam213bQ9DB60 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam213bQ9DB60 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fam213bQ9DB60 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam213bQ9DB60 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Fam213bQ9DB60 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam213bQ9DB60 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam213bQ9DB60 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam213bQ9DB60 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam213bQ9DB60 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Fam213bQ9DB60 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam213bQ9DB60 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam213bQ9DB60 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam213bQ9DB60 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam213bQ9DB60 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam213bQ9DB60 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam213bQ9DB60 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam213bQ9DB60 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Fam213bQ9DB60 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Fam213bQ9DB60 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fam213bQ9DB60 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fam213bQ9DB60 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fam213bQ9DB60 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Fam213bQ9DB60 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fam213bQ9DB60 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fam213bQ9DB60 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Fam213bQ9DB60 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fam213bQ9DB60 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fam213bQ9DB60 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fam213bQ9DB60 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fam213bQ9DB60 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fam213bQ9DB60 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Fam213bQ9DB60 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam213bQ9DB60 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam213bQ9DB60 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Fam213bQ9DB60 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam213bQ9DB60 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam213bQ9DB60 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam213bQ9DB60 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam213bQ9DB60 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam213bQ9DB60 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fam213bQ9DB60 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam213bQ9DB60 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fam213bQ9DB60 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam213bQ9DB60 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam213bQ9DB60 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam213bQ9DB60 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam213bQ9DB60 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam213bQ9DB60 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fam213bQ9DB60 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam213bQ9DB60 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam213bQ9DB60 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam213bQ9DB60 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam213bQ9DB60 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam213bQ9DB60 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam213bQ9DB60 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fam213bQ9DB60 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms