Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW5

TIPIN, TIMELESS-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIPINQ9BVW5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TIPINQ9BVW5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TIPINQ9BVW5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TIPINQ9BVW5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TIPINQ9BVW5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TIPINQ9BVW5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TIPINQ9BVW5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TIPINQ9BVW5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TIPINQ9BVW5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TIPINQ9BVW5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
TIPINQ9BVW5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TIPINQ9BVW5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TIPINQ9BVW5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TIPINQ9BVW5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TIPINQ9BVW5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TIPINQ9BVW5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TIPINQ9BVW5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TIPINQ9BVW5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TIPINQ9BVW5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TIPINQ9BVW5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TIPINQ9BVW5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TIPINQ9BVW5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TIPINQ9BVW5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TIPINQ9BVW5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TIPINQ9BVW5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TIPINQ9BVW5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TIPINQ9BVW5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TIPINQ9BVW5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TIPINQ9BVW5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
TIPINQ9BVW5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TIPINQ9BVW5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TIPINQ9BVW5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TIPINQ9BVW5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TIPINQ9BVW5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TIPINQ9BVW5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TIPINQ9BVW5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TIPINQ9BVW5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TIPINQ9BVW5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TIPINQ9BVW5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TIPINQ9BVW5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TIPINQ9BVW5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TIPINQ9BVW5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TIPINQ9BVW5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TIPINQ9BVW5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
TIPINQ9BVW5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TIPINQ9BVW5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TIPINQ9BVW5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TIPINQ9BVW5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TIPINQ9BVW5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TIPINQ9BVW5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TIPINQ9BVW5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TIPINQ9BVW5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TIPINQ9BVW5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TIPINQ9BVW5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TIPINQ9BVW5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TIPINQ9BVW5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TIPINQ9BVW5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TIPINQ9BVW5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TIPINQ9BVW5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TIPINQ9BVW5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TIPINQ9BVW5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TIPINQ9BVW5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TIPINQ9BVW5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TIPINQ9BVW5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TIPINQ9BVW5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TIPINQ9BVW5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TIPINQ9BVW5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TIPINQ9BVW5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TIPINQ9BVW5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TIPINQ9BVW5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TIPINQ9BVW5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TIPINQ9BVW5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TIPINQ9BVW5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TIPINQ9BVW5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TIPINQ9BVW5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TIPINQ9BVW5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TIPINQ9BVW5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TIPINQ9BVW5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TIPINQ9BVW5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TIPINQ9BVW5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TIPINQ9BVW5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TIPINQ9BVW5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TIPINQ9BVW5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TIPINQ9BVW5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TIPINQ9BVW5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TIPINQ9BVW5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TIPINQ9BVW5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TIPINQ9BVW5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TIPINQ9BVW5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TIPINQ9BVW5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TIPINQ9BVW5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TIPINQ9BVW5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TIPINQ9BVW5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TIPINQ9BVW5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TIPINQ9BVW5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TIPINQ9BVW5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TIPINQ9BVW5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TIPINQ9BVW5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TIPINQ9BVW5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TIPINQ9BVW5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms