Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
C2orf88Q9BSF0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C2orf88Q9BSF0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
C2orf88Q9BSF0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
C2orf88Q9BSF0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C2orf88Q9BSF0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C2orf88Q9BSF0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C2orf88Q9BSF0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C2orf88Q9BSF0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
C2orf88Q9BSF0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C2orf88Q9BSF0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C2orf88Q9BSF0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
C2orf88Q9BSF0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C2orf88Q9BSF0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
C2orf88Q9BSF0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C2orf88Q9BSF0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C2orf88Q9BSF0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C2orf88Q9BSF0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C2orf88Q9BSF0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
C2orf88Q9BSF0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C2orf88Q9BSF0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C2orf88Q9BSF0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C2orf88Q9BSF0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C2orf88Q9BSF0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C2orf88Q9BSF0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C2orf88Q9BSF0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C2orf88Q9BSF0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C2orf88Q9BSF0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C2orf88Q9BSF0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C2orf88Q9BSF0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C2orf88Q9BSF0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C2orf88Q9BSF0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C2orf88Q9BSF0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C2orf88Q9BSF0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C2orf88Q9BSF0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
C2orf88Q9BSF0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
C2orf88Q9BSF0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
C2orf88Q9BSF0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C2orf88Q9BSF0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
C2orf88Q9BSF0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
C2orf88Q9BSF0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
C2orf88Q9BSF0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
C2orf88Q9BSF0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
C2orf88Q9BSF0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
C2orf88Q9BSF0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C2orf88Q9BSF0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C2orf88Q9BSF0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
C2orf88Q9BSF0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C2orf88Q9BSF0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
C2orf88Q9BSF0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C2orf88Q9BSF0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C2orf88Q9BSF0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
C2orf88Q9BSF0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C2orf88Q9BSF0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
C2orf88Q9BSF0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C2orf88Q9BSF0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C2orf88Q9BSF0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C2orf88Q9BSF0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C2orf88Q9BSF0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
C2orf88Q9BSF0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
C2orf88Q9BSF0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C2orf88Q9BSF0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C2orf88Q9BSF0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C2orf88Q9BSF0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C2orf88Q9BSF0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
C2orf88Q9BSF0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C2orf88Q9BSF0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C2orf88Q9BSF0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
C2orf88Q9BSF0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
C2orf88Q9BSF0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C2orf88Q9BSF0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C2orf88Q9BSF0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C2orf88Q9BSF0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C2orf88Q9BSF0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C2orf88Q9BSF0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
C2orf88Q9BSF0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C2orf88Q9BSF0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C2orf88Q9BSF0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C2orf88Q9BSF0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C2orf88Q9BSF0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C2orf88Q9BSF0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
C2orf88Q9BSF0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C2orf88Q9BSF0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
C2orf88Q9BSF0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C2orf88Q9BSF0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
C2orf88Q9BSF0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
C2orf88Q9BSF0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C2orf88Q9BSF0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C2orf88Q9BSF0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C2orf88Q9BSF0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C2orf88Q9BSF0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C2orf88Q9BSF0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C2orf88Q9BSF0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C2orf88Q9BSF0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C2orf88Q9BSF0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C2orf88Q9BSF0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C2orf88Q9BSF0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
C2orf88Q9BSF0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C2orf88Q9BSF0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
C2orf88Q9BSF0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms