Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPGRIP1Q96KN7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPGRIP1Q96KN7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPGRIP1Q96KN7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPGRIP1Q96KN7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPGRIP1Q96KN7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RPGRIP1Q96KN7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPGRIP1Q96KN7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPGRIP1Q96KN7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPGRIP1Q96KN7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPGRIP1Q96KN7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPGRIP1Q96KN7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPGRIP1Q96KN7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPGRIP1Q96KN7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPGRIP1Q96KN7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPGRIP1Q96KN7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPGRIP1Q96KN7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPGRIP1Q96KN7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPGRIP1Q96KN7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPGRIP1Q96KN7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPGRIP1Q96KN7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPGRIP1Q96KN7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPGRIP1Q96KN7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPGRIP1Q96KN7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPGRIP1Q96KN7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPGRIP1Q96KN7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPGRIP1Q96KN7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
RPGRIP1Q96KN7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPGRIP1Q96KN7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPGRIP1Q96KN7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RPGRIP1Q96KN7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RPGRIP1Q96KN7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RPGRIP1Q96KN7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RPGRIP1Q96KN7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RPGRIP1Q96KN7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RPGRIP1Q96KN7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RPGRIP1Q96KN7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RPGRIP1Q96KN7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPGRIP1Q96KN7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPGRIP1Q96KN7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPGRIP1Q96KN7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPGRIP1Q96KN7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPGRIP1Q96KN7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPGRIP1Q96KN7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPGRIP1Q96KN7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPGRIP1Q96KN7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPGRIP1Q96KN7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPGRIP1Q96KN7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPGRIP1Q96KN7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPGRIP1Q96KN7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RPGRIP1Q96KN7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RPGRIP1Q96KN7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPGRIP1Q96KN7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPGRIP1Q96KN7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPGRIP1Q96KN7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPGRIP1Q96KN7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPGRIP1Q96KN7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPGRIP1Q96KN7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPGRIP1Q96KN7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPGRIP1Q96KN7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPGRIP1Q96KN7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPGRIP1Q96KN7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPGRIP1Q96KN7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPGRIP1Q96KN7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPGRIP1Q96KN7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPGRIP1Q96KN7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RPGRIP1Q96KN7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RPGRIP1Q96KN7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RPGRIP1Q96KN7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RPGRIP1Q96KN7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RPGRIP1Q96KN7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RPGRIP1Q96KN7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RPGRIP1Q96KN7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RPGRIP1Q96KN7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RPGRIP1Q96KN7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RPGRIP1Q96KN7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RPGRIP1Q96KN7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPGRIP1Q96KN7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPGRIP1Q96KN7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPGRIP1Q96KN7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPGRIP1Q96KN7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPGRIP1Q96KN7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPGRIP1Q96KN7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPGRIP1Q96KN7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPGRIP1Q96KN7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPGRIP1Q96KN7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPGRIP1Q96KN7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPGRIP1Q96KN7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPGRIP1Q96KN7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPGRIP1Q96KN7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPGRIP1Q96KN7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPGRIP1Q96KN7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPGRIP1Q96KN7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPGRIP1Q96KN7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPGRIP1Q96KN7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RPGRIP1Q96KN7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPGRIP1Q96KN7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPGRIP1Q96KN7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPGRIP1Q96KN7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPGRIP1Q96KN7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 279.1 ms