Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00612Q8N6U2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00612Q8N6U2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00612Q8N6U2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00612Q8N6U2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00612Q8N6U2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00612Q8N6U2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00612Q8N6U2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00612Q8N6U2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00612Q8N6U2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00612Q8N6U2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00612Q8N6U2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00612Q8N6U2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00612Q8N6U2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00612Q8N6U2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00612Q8N6U2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00612Q8N6U2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00612Q8N6U2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00612Q8N6U2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00612Q8N6U2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00612Q8N6U2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00612Q8N6U2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00612Q8N6U2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00612Q8N6U2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00612Q8N6U2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00612Q8N6U2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00612Q8N6U2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00612Q8N6U2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00612Q8N6U2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00612Q8N6U2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00612Q8N6U2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00612Q8N6U2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00612Q8N6U2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00612Q8N6U2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00612Q8N6U2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00612Q8N6U2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00612Q8N6U2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00612Q8N6U2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00612Q8N6U2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00612Q8N6U2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00612Q8N6U2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00612Q8N6U2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00612Q8N6U2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00612Q8N6U2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00612Q8N6U2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00612Q8N6U2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00612Q8N6U2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00612Q8N6U2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00612Q8N6U2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00612Q8N6U2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00612Q8N6U2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00612Q8N6U2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00612Q8N6U2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00612Q8N6U2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00612Q8N6U2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00612Q8N6U2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00612Q8N6U2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00612Q8N6U2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00612Q8N6U2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00612Q8N6U2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00612Q8N6U2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00612Q8N6U2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00612Q8N6U2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00612Q8N6U2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00612Q8N6U2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00612Q8N6U2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LINC00612Q8N6U2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00612Q8N6U2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00612Q8N6U2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LINC00612Q8N6U2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00612Q8N6U2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00612Q8N6U2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00612Q8N6U2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00612Q8N6U2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00612Q8N6U2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
LINC00612Q8N6U2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00612Q8N6U2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00612Q8N6U2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00612Q8N6U2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00612Q8N6U2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00612Q8N6U2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00612Q8N6U2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00612Q8N6U2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00612Q8N6U2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00612Q8N6U2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00612Q8N6U2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00612Q8N6U2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00612Q8N6U2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00612Q8N6U2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00612Q8N6U2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00612Q8N6U2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00612Q8N6U2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00612Q8N6U2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00612Q8N6U2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00612Q8N6U2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00612Q8N6U2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00612Q8N6U2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00612Q8N6U2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00612Q8N6U2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00612Q8N6U2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms