Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q795

Putative viral protein-binding protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6Q795 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6Q795 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6Q795 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q6Q795 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6Q795 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6Q795 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6Q795 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6Q795 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q6Q795 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6Q795 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6Q795 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6Q795 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6Q795 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6Q795 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6Q795 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6Q795 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6Q795 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6Q795 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q6Q795 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6Q795 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q6Q795 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6Q795 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6Q795 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6Q795 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6Q795 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q6Q795 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6Q795 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6Q795 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6Q795 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6Q795 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q6Q795 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6Q795 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6Q795 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6Q795 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6Q795 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6Q795 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6Q795 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6Q795 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6Q795 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q6Q795 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6Q795 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6Q795 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6Q795 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6Q795 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6Q795 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q6Q795 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6Q795 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6Q795 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6Q795 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6Q795 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q6Q795 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q6Q795 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q6Q795 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q6Q795 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q6Q795 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q6Q795 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q6Q795 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q6Q795 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6Q795 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6Q795 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6Q795 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6Q795 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q6Q795 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q6Q795 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q6Q795 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q6Q795 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q6Q795 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q6Q795 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q6Q795 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q6Q795 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q6Q795 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q6Q795 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q6Q795 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q6Q795 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q6Q795 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q6Q795 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q6Q795 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Q6Q795 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6Q795 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6Q795 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6Q795 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6Q795 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q6Q795 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q6Q795 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q6Q795 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q6Q795 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q6Q795 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q6Q795 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q6Q795 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q6Q795 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6Q795 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6Q795 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6Q795 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6Q795 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6Q795 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6Q795 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6Q795 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q6Q795 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q6Q795 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Q6Q795 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms