Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Z2

PKN3, Serine/threonine-protein kinase N3, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN3Q6P5Z2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PKN3Q6P5Z2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PKN3Q6P5Z2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKN3Q6P5Z2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKN3Q6P5Z2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKN3Q6P5Z2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKN3Q6P5Z2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKN3Q6P5Z2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PKN3Q6P5Z2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PKN3Q6P5Z2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PKN3Q6P5Z2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PKN3Q6P5Z2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PKN3Q6P5Z2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PKN3Q6P5Z2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PKN3Q6P5Z2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PKN3Q6P5Z2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PKN3Q6P5Z2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PKN3Q6P5Z2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PKN3Q6P5Z2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PKN3Q6P5Z2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PKN3Q6P5Z2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PKN3Q6P5Z2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PKN3Q6P5Z2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PKN3Q6P5Z2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PKN3Q6P5Z2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PKN3Q6P5Z2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PKN3Q6P5Z2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PKN3Q6P5Z2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PKN3Q6P5Z2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PKN3Q6P5Z2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PKN3Q6P5Z2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PKN3Q6P5Z2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PKN3Q6P5Z2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PKN3Q6P5Z2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PKN3Q6P5Z2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PKN3Q6P5Z2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PKN3Q6P5Z2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PKN3Q6P5Z2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PKN3Q6P5Z2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PKN3Q6P5Z2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PKN3Q6P5Z2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PKN3Q6P5Z2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PKN3Q6P5Z2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PKN3Q6P5Z2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PKN3Q6P5Z2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PKN3Q6P5Z2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PKN3Q6P5Z2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PKN3Q6P5Z2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PKN3Q6P5Z2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PKN3Q6P5Z2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PKN3Q6P5Z2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PKN3Q6P5Z2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PKN3Q6P5Z2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PKN3Q6P5Z2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PKN3Q6P5Z2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
PKN3Q6P5Z2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
PKN3Q6P5Z2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PKN3Q6P5Z2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PKN3Q6P5Z2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PKN3Q6P5Z2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PKN3Q6P5Z2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PKN3Q6P5Z2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PKN3Q6P5Z2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PKN3Q6P5Z2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PKN3Q6P5Z2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PKN3Q6P5Z2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PKN3Q6P5Z2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PKN3Q6P5Z2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PKN3Q6P5Z2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PKN3Q6P5Z2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PKN3Q6P5Z2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PKN3Q6P5Z2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PKN3Q6P5Z2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PKN3Q6P5Z2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PKN3Q6P5Z2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PKN3Q6P5Z2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PKN3Q6P5Z2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PKN3Q6P5Z2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PKN3Q6P5Z2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PKN3Q6P5Z2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PKN3Q6P5Z2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PKN3Q6P5Z2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PKN3Q6P5Z2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PKN3Q6P5Z2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PKN3Q6P5Z2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PKN3Q6P5Z2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PKN3Q6P5Z2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PKN3Q6P5Z2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PKN3Q6P5Z2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PKN3Q6P5Z2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PKN3Q6P5Z2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PKN3Q6P5Z2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PKN3Q6P5Z2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PKN3Q6P5Z2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PKN3Q6P5Z2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PKN3Q6P5Z2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PKN3Q6P5Z2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PKN3Q6P5Z2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PKN3Q6P5Z2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PKN3Q6P5Z2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms