Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TAF3Q5VWG9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TAF3Q5VWG9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TAF3Q5VWG9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TAF3Q5VWG9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TAF3Q5VWG9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TAF3Q5VWG9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TAF3Q5VWG9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TAF3Q5VWG9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TAF3Q5VWG9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TAF3Q5VWG9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TAF3Q5VWG9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TAF3Q5VWG9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TAF3Q5VWG9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TAF3Q5VWG9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TAF3Q5VWG9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TAF3Q5VWG9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TAF3Q5VWG9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TAF3Q5VWG9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TAF3Q5VWG9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TAF3Q5VWG9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TAF3Q5VWG9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TAF3Q5VWG9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TAF3Q5VWG9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TAF3Q5VWG9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TAF3Q5VWG9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TAF3Q5VWG9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TAF3Q5VWG9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TAF3Q5VWG9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TAF3Q5VWG9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TAF3Q5VWG9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TAF3Q5VWG9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TAF3Q5VWG9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TAF3Q5VWG9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TAF3Q5VWG9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TAF3Q5VWG9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TAF3Q5VWG9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TAF3Q5VWG9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TAF3Q5VWG9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TAF3Q5VWG9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TAF3Q5VWG9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TAF3Q5VWG9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TAF3Q5VWG9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TAF3Q5VWG9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TAF3Q5VWG9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TAF3Q5VWG9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TAF3Q5VWG9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TAF3Q5VWG9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TAF3Q5VWG9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TAF3Q5VWG9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TAF3Q5VWG9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TAF3Q5VWG9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TAF3Q5VWG9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TAF3Q5VWG9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TAF3Q5VWG9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TAF3Q5VWG9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TAF3Q5VWG9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TAF3Q5VWG9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TAF3Q5VWG9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TAF3Q5VWG9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TAF3Q5VWG9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TAF3Q5VWG9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TAF3Q5VWG9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TAF3Q5VWG9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TAF3Q5VWG9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TAF3Q5VWG9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TAF3Q5VWG9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TAF3Q5VWG9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TAF3Q5VWG9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TAF3Q5VWG9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TAF3Q5VWG9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TAF3Q5VWG9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TAF3Q5VWG9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TAF3Q5VWG9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TAF3Q5VWG9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TAF3Q5VWG9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TAF3Q5VWG9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TAF3Q5VWG9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TAF3Q5VWG9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TAF3Q5VWG9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TAF3Q5VWG9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TAF3Q5VWG9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TAF3Q5VWG9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TAF3Q5VWG9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TAF3Q5VWG9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TAF3Q5VWG9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TAF3Q5VWG9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TAF3Q5VWG9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TAF3Q5VWG9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TAF3Q5VWG9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TAF3Q5VWG9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TAF3Q5VWG9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TAF3Q5VWG9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TAF3Q5VWG9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TAF3Q5VWG9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TAF3Q5VWG9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TAF3Q5VWG9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TAF3Q5VWG9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TAF3Q5VWG9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TAF3Q5VWG9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms