Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTE0

EEF1A1P5, Putative elongation factor 1-alpha-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P5Q5VTE0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EEF1A1P5Q5VTE0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EEF1A1P5Q5VTE0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EEF1A1P5Q5VTE0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EEF1A1P5Q5VTE0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EEF1A1P5Q5VTE0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EEF1A1P5Q5VTE0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EEF1A1P5Q5VTE0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EEF1A1P5Q5VTE0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EEF1A1P5Q5VTE0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EEF1A1P5Q5VTE0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EEF1A1P5Q5VTE0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EEF1A1P5Q5VTE0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EEF1A1P5Q5VTE0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EEF1A1P5Q5VTE0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EEF1A1P5Q5VTE0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EEF1A1P5Q5VTE0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EEF1A1P5Q5VTE0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EEF1A1P5Q5VTE0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EEF1A1P5Q5VTE0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EEF1A1P5Q5VTE0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EEF1A1P5Q5VTE0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EEF1A1P5Q5VTE0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EEF1A1P5Q5VTE0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EEF1A1P5Q5VTE0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EEF1A1P5Q5VTE0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EEF1A1P5Q5VTE0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EEF1A1P5Q5VTE0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EEF1A1P5Q5VTE0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EEF1A1P5Q5VTE0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EEF1A1P5Q5VTE0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EEF1A1P5Q5VTE0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EEF1A1P5Q5VTE0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EEF1A1P5Q5VTE0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EEF1A1P5Q5VTE0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EEF1A1P5Q5VTE0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EEF1A1P5Q5VTE0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EEF1A1P5Q5VTE0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EEF1A1P5Q5VTE0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EEF1A1P5Q5VTE0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EEF1A1P5Q5VTE0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EEF1A1P5Q5VTE0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EEF1A1P5Q5VTE0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EEF1A1P5Q5VTE0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EEF1A1P5Q5VTE0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EEF1A1P5Q5VTE0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EEF1A1P5Q5VTE0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EEF1A1P5Q5VTE0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EEF1A1P5Q5VTE0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EEF1A1P5Q5VTE0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EEF1A1P5Q5VTE0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EEF1A1P5Q5VTE0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EEF1A1P5Q5VTE0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EEF1A1P5Q5VTE0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EEF1A1P5Q5VTE0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EEF1A1P5Q5VTE0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EEF1A1P5Q5VTE0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EEF1A1P5Q5VTE0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EEF1A1P5Q5VTE0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EEF1A1P5Q5VTE0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EEF1A1P5Q5VTE0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EEF1A1P5Q5VTE0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EEF1A1P5Q5VTE0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EEF1A1P5Q5VTE0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EEF1A1P5Q5VTE0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EEF1A1P5Q5VTE0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EEF1A1P5Q5VTE0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EEF1A1P5Q5VTE0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EEF1A1P5Q5VTE0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EEF1A1P5Q5VTE0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EEF1A1P5Q5VTE0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
EEF1A1P5Q5VTE0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EEF1A1P5Q5VTE0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EEF1A1P5Q5VTE0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EEF1A1P5Q5VTE0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EEF1A1P5Q5VTE0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EEF1A1P5Q5VTE0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EEF1A1P5Q5VTE0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EEF1A1P5Q5VTE0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EEF1A1P5Q5VTE0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EEF1A1P5Q5VTE0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EEF1A1P5Q5VTE0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EEF1A1P5Q5VTE0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EEF1A1P5Q5VTE0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EEF1A1P5Q5VTE0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EEF1A1P5Q5VTE0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EEF1A1P5Q5VTE0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EEF1A1P5Q5VTE0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EEF1A1P5Q5VTE0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EEF1A1P5Q5VTE0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EEF1A1P5Q5VTE0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EEF1A1P5Q5VTE0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EEF1A1P5Q5VTE0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EEF1A1P5Q5VTE0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EEF1A1P5Q5VTE0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EEF1A1P5Q5VTE0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EEF1A1P5Q5VTE0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EEF1A1P5Q5VTE0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EEF1A1P5Q5VTE0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EEF1A1P5Q5VTE0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms