Protein–RNA interactions for Protein: Q5T011

SZT2, KICSTOR complex protein SZT2, humanhuman

Predictions only

Length 3,432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZT2Q5T011 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SZT2Q5T011 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SZT2Q5T011 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SZT2Q5T011 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SZT2Q5T011 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SZT2Q5T011 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SZT2Q5T011 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SZT2Q5T011 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SZT2Q5T011 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SZT2Q5T011 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SZT2Q5T011 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SZT2Q5T011 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SZT2Q5T011 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SZT2Q5T011 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SZT2Q5T011 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SZT2Q5T011 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SZT2Q5T011 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
SZT2Q5T011 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SZT2Q5T011 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SZT2Q5T011 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SZT2Q5T011 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SZT2Q5T011 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SZT2Q5T011 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SZT2Q5T011 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SZT2Q5T011 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SZT2Q5T011 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SZT2Q5T011 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SZT2Q5T011 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SZT2Q5T011 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SZT2Q5T011 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SZT2Q5T011 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SZT2Q5T011 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SZT2Q5T011 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SZT2Q5T011 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SZT2Q5T011 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SZT2Q5T011 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SZT2Q5T011 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SZT2Q5T011 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SZT2Q5T011 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SZT2Q5T011 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SZT2Q5T011 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SZT2Q5T011 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SZT2Q5T011 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SZT2Q5T011 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SZT2Q5T011 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SZT2Q5T011 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SZT2Q5T011 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SZT2Q5T011 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SZT2Q5T011 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SZT2Q5T011 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SZT2Q5T011 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SZT2Q5T011 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SZT2Q5T011 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SZT2Q5T011 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SZT2Q5T011 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SZT2Q5T011 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SZT2Q5T011 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SZT2Q5T011 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SZT2Q5T011 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SZT2Q5T011 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SZT2Q5T011 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SZT2Q5T011 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SZT2Q5T011 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SZT2Q5T011 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SZT2Q5T011 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SZT2Q5T011 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SZT2Q5T011 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SZT2Q5T011 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SZT2Q5T011 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SZT2Q5T011 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SZT2Q5T011 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SZT2Q5T011 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SZT2Q5T011 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SZT2Q5T011 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SZT2Q5T011 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SZT2Q5T011 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SZT2Q5T011 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SZT2Q5T011 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SZT2Q5T011 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SZT2Q5T011 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SZT2Q5T011 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SZT2Q5T011 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SZT2Q5T011 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SZT2Q5T011 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SZT2Q5T011 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28■■■□□ 2.07
SZT2Q5T011 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
SZT2Q5T011 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SZT2Q5T011 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SZT2Q5T011 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SZT2Q5T011 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SZT2Q5T011 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SZT2Q5T011 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SZT2Q5T011 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SZT2Q5T011 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SZT2Q5T011 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SZT2Q5T011 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SZT2Q5T011 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SZT2Q5T011 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SZT2Q5T011 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SZT2Q5T011 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms