Protein–RNA interactions for Protein: Q3V096

Ankrd42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd42Q3V096 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ankrd42Q3V096 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ankrd42Q3V096 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ankrd42Q3V096 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ankrd42Q3V096 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ankrd42Q3V096 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ankrd42Q3V096 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ankrd42Q3V096 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ankrd42Q3V096 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ankrd42Q3V096 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ankrd42Q3V096 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ankrd42Q3V096 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ankrd42Q3V096 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ankrd42Q3V096 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ankrd42Q3V096 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ankrd42Q3V096 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ankrd42Q3V096 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ankrd42Q3V096 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ankrd42Q3V096 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ankrd42Q3V096 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ankrd42Q3V096 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ankrd42Q3V096 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ankrd42Q3V096 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ankrd42Q3V096 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ankrd42Q3V096 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ankrd42Q3V096 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ankrd42Q3V096 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ankrd42Q3V096 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ankrd42Q3V096 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ankrd42Q3V096 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ankrd42Q3V096 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ankrd42Q3V096 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ankrd42Q3V096 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ankrd42Q3V096 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ankrd42Q3V096 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ankrd42Q3V096 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ankrd42Q3V096 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ankrd42Q3V096 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ankrd42Q3V096 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ankrd42Q3V096 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ankrd42Q3V096 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ankrd42Q3V096 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ankrd42Q3V096 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ankrd42Q3V096 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ankrd42Q3V096 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ankrd42Q3V096 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ankrd42Q3V096 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ankrd42Q3V096 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ankrd42Q3V096 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ankrd42Q3V096 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ankrd42Q3V096 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ankrd42Q3V096 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ankrd42Q3V096 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ankrd42Q3V096 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ankrd42Q3V096 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ankrd42Q3V096 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ankrd42Q3V096 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ankrd42Q3V096 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ankrd42Q3V096 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ankrd42Q3V096 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ankrd42Q3V096 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ankrd42Q3V096 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ankrd42Q3V096 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ankrd42Q3V096 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ankrd42Q3V096 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ankrd42Q3V096 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ankrd42Q3V096 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ankrd42Q3V096 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ankrd42Q3V096 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ankrd42Q3V096 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ankrd42Q3V096 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ankrd42Q3V096 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ankrd42Q3V096 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ankrd42Q3V096 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ankrd42Q3V096 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ankrd42Q3V096 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ankrd42Q3V096 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ankrd42Q3V096 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ankrd42Q3V096 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ankrd42Q3V096 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ankrd42Q3V096 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ankrd42Q3V096 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ankrd42Q3V096 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ankrd42Q3V096 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ankrd42Q3V096 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ankrd42Q3V096 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ankrd42Q3V096 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ankrd42Q3V096 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ankrd42Q3V096 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ankrd42Q3V096 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ankrd42Q3V096 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ankrd42Q3V096 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ankrd42Q3V096 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ankrd42Q3V096 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ankrd42Q3V096 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ankrd42Q3V096 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ankrd42Q3V096 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ankrd42Q3V096 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ankrd42Q3V096 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ankrd42Q3V096 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms