Protein–RNA interactions for Protein: Q32NY4

Cnnm3, Metal transporter CNNM3, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm3Q32NY4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Cnnm3Q32NY4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cnnm3Q32NY4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cnnm3Q32NY4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Cnnm3Q32NY4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cnnm3Q32NY4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.54■■■□□ 2
Cnnm3Q32NY4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cnnm3Q32NY4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Cnnm3Q32NY4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cnnm3Q32NY4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cnnm3Q32NY4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cnnm3Q32NY4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cnnm3Q32NY4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cnnm3Q32NY4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cnnm3Q32NY4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cnnm3Q32NY4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cnnm3Q32NY4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cnnm3Q32NY4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cnnm3Q32NY4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cnnm3Q32NY4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cnnm3Q32NY4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cnnm3Q32NY4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cnnm3Q32NY4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cnnm3Q32NY4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cnnm3Q32NY4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cnnm3Q32NY4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cnnm3Q32NY4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cnnm3Q32NY4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cnnm3Q32NY4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cnnm3Q32NY4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cnnm3Q32NY4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cnnm3Q32NY4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cnnm3Q32NY4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cnnm3Q32NY4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cnnm3Q32NY4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cnnm3Q32NY4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cnnm3Q32NY4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cnnm3Q32NY4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cnnm3Q32NY4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cnnm3Q32NY4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cnnm3Q32NY4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cnnm3Q32NY4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cnnm3Q32NY4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cnnm3Q32NY4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cnnm3Q32NY4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cnnm3Q32NY4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cnnm3Q32NY4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Cnnm3Q32NY4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cnnm3Q32NY4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cnnm3Q32NY4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cnnm3Q32NY4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cnnm3Q32NY4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cnnm3Q32NY4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cnnm3Q32NY4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cnnm3Q32NY4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cnnm3Q32NY4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cnnm3Q32NY4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cnnm3Q32NY4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cnnm3Q32NY4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cnnm3Q32NY4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cnnm3Q32NY4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cnnm3Q32NY4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cnnm3Q32NY4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cnnm3Q32NY4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cnnm3Q32NY4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cnnm3Q32NY4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Cnnm3Q32NY4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cnnm3Q32NY4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cnnm3Q32NY4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cnnm3Q32NY4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cnnm3Q32NY4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cnnm3Q32NY4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cnnm3Q32NY4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cnnm3Q32NY4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cnnm3Q32NY4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cnnm3Q32NY4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Cnnm3Q32NY4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cnnm3Q32NY4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cnnm3Q32NY4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cnnm3Q32NY4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cnnm3Q32NY4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cnnm3Q32NY4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cnnm3Q32NY4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cnnm3Q32NY4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Cnnm3Q32NY4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cnnm3Q32NY4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cnnm3Q32NY4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cnnm3Q32NY4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cnnm3Q32NY4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cnnm3Q32NY4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cnnm3Q32NY4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cnnm3Q32NY4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cnnm3Q32NY4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cnnm3Q32NY4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cnnm3Q32NY4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Cnnm3Q32NY4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cnnm3Q32NY4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cnnm3Q32NY4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cnnm3Q32NY4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cnnm3Q32NY4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms