Protein–RNA interactions for Protein: Q15742

NAB2, NGFI-A-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAB2Q15742 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NAB2Q15742 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NAB2Q15742 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NAB2Q15742 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NAB2Q15742 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NAB2Q15742 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NAB2Q15742 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NAB2Q15742 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NAB2Q15742 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NAB2Q15742 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NAB2Q15742 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NAB2Q15742 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NAB2Q15742 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NAB2Q15742 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NAB2Q15742 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NAB2Q15742 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NAB2Q15742 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NAB2Q15742 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NAB2Q15742 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NAB2Q15742 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NAB2Q15742 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NAB2Q15742 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NAB2Q15742 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NAB2Q15742 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NAB2Q15742 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NAB2Q15742 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
NAB2Q15742 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NAB2Q15742 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NAB2Q15742 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NAB2Q15742 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NAB2Q15742 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NAB2Q15742 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NAB2Q15742 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NAB2Q15742 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NAB2Q15742 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NAB2Q15742 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NAB2Q15742 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NAB2Q15742 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NAB2Q15742 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NAB2Q15742 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NAB2Q15742 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NAB2Q15742 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NAB2Q15742 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NAB2Q15742 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NAB2Q15742 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NAB2Q15742 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NAB2Q15742 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NAB2Q15742 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NAB2Q15742 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NAB2Q15742 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NAB2Q15742 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NAB2Q15742 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NAB2Q15742 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NAB2Q15742 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NAB2Q15742 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NAB2Q15742 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NAB2Q15742 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NAB2Q15742 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NAB2Q15742 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NAB2Q15742 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NAB2Q15742 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NAB2Q15742 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
NAB2Q15742 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NAB2Q15742 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NAB2Q15742 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NAB2Q15742 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NAB2Q15742 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NAB2Q15742 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NAB2Q15742 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NAB2Q15742 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NAB2Q15742 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NAB2Q15742 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NAB2Q15742 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NAB2Q15742 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NAB2Q15742 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NAB2Q15742 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NAB2Q15742 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NAB2Q15742 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NAB2Q15742 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NAB2Q15742 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NAB2Q15742 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NAB2Q15742 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NAB2Q15742 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NAB2Q15742 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
NAB2Q15742 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NAB2Q15742 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NAB2Q15742 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NAB2Q15742 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NAB2Q15742 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NAB2Q15742 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NAB2Q15742 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NAB2Q15742 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NAB2Q15742 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NAB2Q15742 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NAB2Q15742 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NAB2Q15742 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NAB2Q15742 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NAB2Q15742 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NAB2Q15742 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NAB2Q15742 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms