Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 RPL2AYFR031C-A 765 nt9.23□□□□□ -0.93
LSP1Q12230 OLA1YBR025C 1185 nt9.23□□□□□ -0.93
LSP1Q12230 MET30YIL046W 1923 nt9.23□□□□□ -0.93
LSP1Q12230 ARO3YDR035W 1113 nt9.22□□□□□ -0.93
LSP1Q12230 RNA170RNA170 169 nt9.21□□□□□ -0.94
LSP1Q12230 CHS7YHR142W 951 nt9.2□□□□□ -0.94
LSP1Q12230 SPE4YLR146C 903 nt9.2□□□□□ -0.94
LSP1Q12230 YLR349WYLR349W 507 nt9.2□□□□□ -0.94
LSP1Q12230 ALG7YBR243C 1347 nt9.2□□□□□ -0.94
LSP1Q12230 PRC1YMR297W 1599 nt9.2□□□□□ -0.94
LSP1Q12230 RRT6YGL146C 936 nt9.19□□□□□ -0.94
LSP1Q12230 RCF1YML030W 480 nt9.19□□□□□ -0.94
LSP1Q12230 MET22YOL064C 1074 nt9.19□□□□□ -0.94
LSP1Q12230 MTC6YHR151C 1581 nt9.19□□□□□ -0.94
LSP1Q12230 YRF1-1YDR545W 5391 nt9.19□□□□□ -0.94
LSP1Q12230 YRF1-5YLR467W 5391 nt9.19□□□□□ -0.94
LSP1Q12230 YRF1-8YOR396W 5391 nt9.19□□□□□ -0.94
LSP1Q12230 YGR137WYGR137W 375 nt9.18□□□□□ -0.94
LSP1Q12230 YLR280CYLR280C 351 nt9.18□□□□□ -0.94
LSP1Q12230 YNL190WYNL190W 615 nt9.18□□□□□ -0.94
LSP1Q12230 WSC3YOL105C 1671 nt9.17□□□□□ -0.94
LSP1Q12230 YER152CYER152C 1332 nt9.17□□□□□ -0.94
LSP1Q12230 NSG2YNL156C 900 nt9.17□□□□□ -0.94
LSP1Q12230 SGF73YGL066W 1974 nt9.16□□□□□ -0.94
LSP1Q12230 HXT9YJL219W 1704 nt9.16□□□□□ -0.94
LSP1Q12230 RSC4YKR008W 1878 nt9.15□□□□□ -0.94
LSP1Q12230 ADH7YCR105W 1086 nt9.15□□□□□ -0.94
LSP1Q12230 ELP6YMR312W 822 nt9.15□□□□□ -0.94
LSP1Q12230 RHO1YPR165W 630 nt9.15□□□□□ -0.94
LSP1Q12230 THI73YLR004C 1572 nt9.15□□□□□ -0.95
LSP1Q12230 SNP1YIL061C 903 nt9.14□□□□□ -0.95
LSP1Q12230 FLX1YIL134W 936 nt9.14□□□□□ -0.95
LSP1Q12230 RSC9YML127W 1746 nt9.14□□□□□ -0.95
LSP1Q12230 ERG6YML008C 1152 nt9.13□□□□□ -0.95
LSP1Q12230 AVL9YLR114C 2295 nt9.13□□□□□ -0.95
LSP1Q12230 ITR1YDR497C 1755 nt9.12□□□□□ -0.95
LSP1Q12230 SHC1YER096W 1539 nt9.12□□□□□ -0.95
LSP1Q12230 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt9.12□□□□□ -0.95
LSP1Q12230 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt9.12□□□□□ -0.95
LSP1Q12230 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt9.12□□□□□ -0.95
LSP1Q12230 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt9.12□□□□□ -0.95
LSP1Q12230 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt9.12□□□□□ -0.95
LSP1Q12230 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt9.12□□□□□ -0.95
LSP1Q12230 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt9.12□□□□□ -0.95
LSP1Q12230 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt9.12□□□□□ -0.95
LSP1Q12230 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt9.12□□□□□ -0.95
LSP1Q12230 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt9.12□□□□□ -0.95
LSP1Q12230 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt9.12□□□□□ -0.95
LSP1Q12230 BEM1YBR200W 1656 nt9.12□□□□□ -0.95
LSP1Q12230 TPO1YLL028W 1761 nt9.12□□□□□ -0.95
LSP1Q12230 CKB1YGL019W 837 nt9.11□□□□□ -0.95
LSP1Q12230 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt9.11□□□□□ -0.95
LSP1Q12230 PAU15YIR041W 375 nt9.11□□□□□ -0.95
LSP1Q12230 CYC3YAL039C 810 nt9.1□□□□□ -0.95
LSP1Q12230 PDC6YGR087C 1692 nt9.1□□□□□ -0.95
LSP1Q12230 HXT8YJL214W 1710 nt9.09□□□□□ -0.95
LSP1Q12230 ATP10YLR393W 840 nt9.09□□□□□ -0.95
LSP1Q12230 PMT1YDL095W 2454 nt9.08□□□□□ -0.96
LSP1Q12230 OCH1YGL038C 1443 nt9.08□□□□□ -0.96
LSP1Q12230 LAS17YOR181W 1902 nt9.08□□□□□ -0.96
LSP1Q12230 TES1YJR019C 1050 nt9.08□□□□□ -0.96
LSP1Q12230 PGC1YPL206C 966 nt9.08□□□□□ -0.96
LSP1Q12230 IPL1YPL209C 1104 nt9.08□□□□□ -0.96
LSP1Q12230 ERO1YML130C 1692 nt9.07□□□□□ -0.96
LSP1Q12230 ALR1YOL130W 2580 nt9.07□□□□□ -0.96
LSP1Q12230 STP3YLR375W 1032 nt9.07□□□□□ -0.96
LSP1Q12230 PUP3YER094C 618 nt9.06□□□□□ -0.96
LSP1Q12230 SRP102YKL154W 735 nt9.06□□□□□ -0.96
LSP1Q12230 CDA1YLR307W 906 nt9.06□□□□□ -0.96
LSP1Q12230 YLR030WYLR030W 792 nt9.05□□□□□ -0.96
LSP1Q12230 RAD51YER095W 1203 nt9.04□□□□□ -0.96
LSP1Q12230 CAK1YFL029C 1107 nt9.04□□□□□ -0.96
LSP1Q12230 YMR253CYMR253C 1245 nt9.04□□□□□ -0.96
LSP1Q12230 YIL177CYIL177C 5277 nt9.04□□□□□ -0.96
LSP1Q12230 PDC5YLR134W 1692 nt9.03□□□□□ -0.96
LSP1Q12230 PEX28YHR150W 1740 nt9.02□□□□□ -0.96
LSP1Q12230 HAM1YJR069C 594 nt9.02□□□□□ -0.97
LSP1Q12230 SNA3YJL151C 402 nt9.01□□□□□ -0.97
LSP1Q12230 ERR3YMR323W 1314 nt9.01□□□□□ -0.97
LSP1Q12230 ERR1YOR393W 1314 nt9.01□□□□□ -0.97
LSP1Q12230 ERR2YPL281C 1314 nt9.01□□□□□ -0.97
LSP1Q12230 RTG2YGL252C 1767 nt9□□□□□ -0.97
LSP1Q12230 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt9□□□□□ -0.97
LSP1Q12230 YMR166CYMR166C 1107 nt9□□□□□ -0.97
LSP1Q12230 LEO1YOR123C 1395 nt8.99□□□□□ -0.97
LSP1Q12230 YLR173WYLR173W 1827 nt8.99□□□□□ -0.97
LSP1Q12230 YPT31YER031C 672 nt8.99□□□□□ -0.97
LSP1Q12230 AOS1YPR180W 1044 nt8.99□□□□□ -0.97
LSP1Q12230 YCR025CYCR025C 411 nt8.98□□□□□ -0.97
LSP1Q12230 TGA1tA(UGC)A 73 nt8.98□□□□□ -0.97
LSP1Q12230 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt8.98□□□□□ -0.97
LSP1Q12230 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt8.98□□□□□ -0.97
LSP1Q12230 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt8.98□□□□□ -0.97
LSP1Q12230 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt8.98□□□□□ -0.97
LSP1Q12230 RCF2YNR018W 675 nt8.98□□□□□ -0.97
LSP1Q12230 LSP1YPL004C 1026 nt8.98□□□□□ -0.97
LSP1Q12230 MNN9YPL050C 1188 nt8.98□□□□□ -0.97
LSP1Q12230 TOP3YLR234W 1971 nt8.97□□□□□ -0.97
LSP1Q12230 DST1YGL043W 930 nt8.96□□□□□ -0.98
LSP1Q12230 RUP1YOR138C 2016 nt8.96□□□□□ -0.98
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