Protein–RNA interactions for Protein: Q12180

HAL9, Halotolerance protein 9, yeastyeast

Predictions only

Length 1,030 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HAL9Q12180 SRP102YKL154W 735 nt7.94□□□□□ -1.14
HAL9Q12180 YPT11YNL304W 1254 nt7.94□□□□□ -1.14
HAL9Q12180 MIM1YOL026C 342 nt7.94□□□□□ -1.14
HAL9Q12180 NPP2YEL016C 1482 nt7.94□□□□□ -1.14
HAL9Q12180 SBP1YHL034C 885 nt7.93□□□□□ -1.14
HAL9Q12180 GAS1YMR307W 1680 nt7.92□□□□□ -1.14
HAL9Q12180 HBS1YKR084C 1836 nt7.92□□□□□ -1.14
HAL9Q12180 YFR020WYFR020W 699 nt7.91□□□□□ -1.14
HAL9Q12180 YLR280CYLR280C 351 nt7.91□□□□□ -1.14
HAL9Q12180 PTC6YCR079W 1329 nt7.91□□□□□ -1.14
HAL9Q12180 ERO1YML130C 1692 nt7.9□□□□□ -1.14
HAL9Q12180 HTS1YPR033C 1641 nt7.9□□□□□ -1.14
HAL9Q12180 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.9□□□□□ -1.14
HAL9Q12180 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.9□□□□□ -1.14
HAL9Q12180 BUR6YER159C 429 nt7.9□□□□□ -1.14
HAL9Q12180 RMA1YKL132C 1293 nt7.9□□□□□ -1.14
HAL9Q12180 THI3YDL080C 1830 nt7.89□□□□□ -1.15
HAL9Q12180 YMR007WYMR007W 381 nt7.89□□□□□ -1.15
HAL9Q12180 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt7.89□□□□□ -1.15
HAL9Q12180 HMT1YBR034C 1047 nt7.88□□□□□ -1.15
HAL9Q12180 MLS1YNL117W 1665 nt7.88□□□□□ -1.15
HAL9Q12180 YDR467CYDR467C 327 nt7.87□□□□□ -1.15
HAL9Q12180 AAC3YBR085W 924 nt7.87□□□□□ -1.15
HAL9Q12180 GGA2YHR108W 1758 nt7.87□□□□□ -1.15
HAL9Q12180 TPN1YGL186C 1740 nt7.86□□□□□ -1.15
HAL9Q12180 DUR3YHL016C 2208 nt7.86□□□□□ -1.15
HAL9Q12180 TGA1tA(UGC)A 73 nt7.86□□□□□ -1.15
HAL9Q12180 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt7.86□□□□□ -1.15
HAL9Q12180 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt7.86□□□□□ -1.15
HAL9Q12180 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt7.86□□□□□ -1.15
HAL9Q12180 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt7.86□□□□□ -1.15
HAL9Q12180 UFD1YGR048W 1086 nt7.86□□□□□ -1.15
HAL9Q12180 YGR210CYGR210C 1236 nt7.86□□□□□ -1.15
HAL9Q12180 GPM1YKL152C 744 nt7.86□□□□□ -1.15
HAL9Q12180 NSG2YNL156C 900 nt7.86□□□□□ -1.15
HAL9Q12180 ATG22YCL038C 1587 nt7.85□□□□□ -1.15
HAL9Q12180 TOM71YHR117W 1920 nt7.85□□□□□ -1.15
HAL9Q12180 POP2YNR052C 1302 nt7.84□□□□□ -1.15
HAL9Q12180 MGM101YJR144W 810 nt7.84□□□□□ -1.15
HAL9Q12180 RCR1YBR005W 642 nt7.84□□□□□ -1.15
HAL9Q12180 FIT1YDR534C 1587 nt7.84□□□□□ -1.15
HAL9Q12180 TRP2YER090W 1524 nt7.83□□□□□ -1.16
HAL9Q12180 ALR1YOL130W 2580 nt7.83□□□□□ -1.16
HAL9Q12180 YER152W-AYER152W-A 567 nt7.83□□□□□ -1.16
HAL9Q12180 RSM7YJR113C 744 nt7.83□□□□□ -1.16
HAL9Q12180 IDP3YNL009W 1263 nt7.83□□□□□ -1.16
HAL9Q12180 YNL165WYNL165W 1221 nt7.83□□□□□ -1.16
HAL9Q12180 HXT11YOL156W 1704 nt7.83□□□□□ -1.16
HAL9Q12180 ECM27YJR106W 2178 nt7.83□□□□□ -1.16
HAL9Q12180 LPD1YFL018C 1500 nt7.83□□□□□ -1.16
HAL9Q12180 THI6YPL214C 1623 nt7.81□□□□□ -1.16
HAL9Q12180 SRN2YLR119W 642 nt7.81□□□□□ -1.16
HAL9Q12180 YPL108WYPL108W 507 nt7.81□□□□□ -1.16
HAL9Q12180 ORT1YOR130C 879 nt7.8□□□□□ -1.16
HAL9Q12180 FCY1YPR062W 477 nt7.79□□□□□ -1.16
HAL9Q12180 YBL095WYBL095W 813 nt7.78□□□□□ -1.16
HAL9Q12180 DUS3YLR401C 2007 nt7.78□□□□□ -1.16
HAL9Q12180 YJL211CYJL211C 444 nt7.77□□□□□ -1.17
HAL9Q12180 SWP1YMR149W 861 nt7.77□□□□□ -1.17
HAL9Q12180 YLR173WYLR173W 1827 nt7.76□□□□□ -1.17
HAL9Q12180 SRM1YGL097W 1449 nt7.76□□□□□ -1.17
HAL9Q12180 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt7.75□□□□□ -1.17
HAL9Q12180 YJL160CYJL160C 864 nt7.75□□□□□ -1.17
HAL9Q12180 EMC3YKL207W 762 nt7.75□□□□□ -1.17
HAL9Q12180 YMR166CYMR166C 1107 nt7.75□□□□□ -1.17
HAL9Q12180 AAT1YKL106W 1356 nt7.74□□□□□ -1.17
HAL9Q12180 EEB1YPL095C 1371 nt7.74□□□□□ -1.17
HAL9Q12180 TMS1YDR105C 1422 nt7.74□□□□□ -1.17
HAL9Q12180 YLR460CYLR460C 1131 nt7.73□□□□□ -1.17
HAL9Q12180 MET22YOL064C 1074 nt7.73□□□□□ -1.17
HAL9Q12180 LSP1YPL004C 1026 nt7.73□□□□□ -1.17
HAL9Q12180 YPL071CYPL071C 471 nt7.73□□□□□ -1.17
HAL9Q12180 snR4snR4 186 nt7.73□□□□□ -1.17
HAL9Q12180 SNU66YOR308C 1764 nt7.73□□□□□ -1.17
HAL9Q12180 BUD20YLR074C 501 nt7.72□□□□□ -1.17
HAL9Q12180 RNA170RNA170 169 nt7.72□□□□□ -1.17
HAL9Q12180 YMC2YBR104W 990 nt7.72□□□□□ -1.17
HAL9Q12180 UBP13YBL067C 2244 nt7.72□□□□□ -1.17
HAL9Q12180 YLR072WYLR072W 2082 nt7.72□□□□□ -1.17
HAL9Q12180 OCH1YGL038C 1443 nt7.71□□□□□ -1.17
HAL9Q12180 PET18YCR020C 648 nt7.7□□□□□ -1.18
HAL9Q12180 CAK1YFL029C 1107 nt7.7□□□□□ -1.18
HAL9Q12180 CHS7YHR142W 951 nt7.7□□□□□ -1.18
HAL9Q12180 YIR035CYIR035C 765 nt7.7□□□□□ -1.18
HAL9Q12180 MRS4YKR052C 915 nt7.7□□□□□ -1.18
HAL9Q12180 RRT14YIL127C 621 nt7.69□□□□□ -1.18
HAL9Q12180 PDC6YGR087C 1692 nt7.69□□□□□ -1.18
HAL9Q12180 YMR210WYMR210W 1350 nt7.69□□□□□ -1.18
HAL9Q12180 ADE16YLR028C 1776 nt7.69□□□□□ -1.18
HAL9Q12180 YIL177CYIL177C 5277 nt7.68□□□□□ -1.18
HAL9Q12180 GRH1YDR517W 1119 nt7.67□□□□□ -1.18
HAL9Q12180 YJR149WYJR149W 1215 nt7.67□□□□□ -1.18
HAL9Q12180 YBR056WYBR056W 1506 nt7.67□□□□□ -1.18
HAL9Q12180 YOR343CYOR343C 327 nt7.66□□□□□ -1.18
HAL9Q12180 HDA1YNL021W 2121 nt7.66□□□□□ -1.18
HAL9Q12180 RTG2YGL252C 1767 nt7.65□□□□□ -1.18
HAL9Q12180 BUB2YMR055C 921 nt7.65□□□□□ -1.18
HAL9Q12180 OLA1YBR025C 1185 nt7.65□□□□□ -1.18
HAL9Q12180 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.64□□□□□ -1.19
HAL9Q12180 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.64□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 9.4 ms