Protein–RNA interactions for Protein: Q12009

TRM8, tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase, yeastyeast

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM8Q12009 PAU22YPL282C 495 nt7.99□□□□□ -1.13
TRM8Q12009 YMR166CYMR166C 1107 nt7.98□□□□□ -1.13
TRM8Q12009 YOR343CYOR343C 327 nt7.98□□□□□ -1.13
TRM8Q12009 EMC3YKL207W 762 nt7.97□□□□□ -1.13
TRM8Q12009 GRH1YDR517W 1119 nt7.96□□□□□ -1.14
TRM8Q12009 LSP1YPL004C 1026 nt7.95□□□□□ -1.14
TRM8Q12009 YMR210WYMR210W 1350 nt7.95□□□□□ -1.14
TRM8Q12009 HRA1HRA1 564 nt7.94□□□□□ -1.14
TRM8Q12009 GPM1YKL152C 744 nt7.94□□□□□ -1.14
TRM8Q12009 YNL190WYNL190W 615 nt7.94□□□□□ -1.14
TRM8Q12009 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt7.93□□□□□ -1.14
TRM8Q12009 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.93□□□□□ -1.14
TRM8Q12009 NPP2YEL016C 1482 nt7.93□□□□□ -1.14
TRM8Q12009 GGA2YHR108W 1758 nt7.92□□□□□ -1.14
TRM8Q12009 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.92□□□□□ -1.14
TRM8Q12009 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.92□□□□□ -1.14
TRM8Q12009 YBL095WYBL095W 813 nt7.92□□□□□ -1.14
TRM8Q12009 AAC3YBR085W 924 nt7.92□□□□□ -1.14
TRM8Q12009 THI3YDL080C 1830 nt7.92□□□□□ -1.14
TRM8Q12009 PET18YCR020C 648 nt7.91□□□□□ -1.14
TRM8Q12009 RRT14YIL127C 621 nt7.91□□□□□ -1.14
TRM8Q12009 YLR460CYLR460C 1131 nt7.91□□□□□ -1.14
TRM8Q12009 YMC2YBR104W 990 nt7.91□□□□□ -1.14
TRM8Q12009 RPL12BYDR418W 498 nt7.9□□□□□ -1.14
TRM8Q12009 OCH1YGL038C 1443 nt7.89□□□□□ -1.15
TRM8Q12009 MRP1YDR347W 966 nt7.89□□□□□ -1.15
TRM8Q12009 CAK1YFL029C 1107 nt7.89□□□□□ -1.15
TRM8Q12009 MGM101YJR144W 810 nt7.89□□□□□ -1.15
TRM8Q12009 YRF1-2YER190W 5046 nt7.89□□□□□ -1.15
TRM8Q12009 NDE1YMR145C 1683 nt7.89□□□□□ -1.15
TRM8Q12009 YER156CYER156C 1017 nt7.88□□□□□ -1.15
TRM8Q12009 CHS7YHR142W 951 nt7.88□□□□□ -1.15
TRM8Q12009 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt7.88□□□□□ -1.15
TRM8Q12009 MET22YOL064C 1074 nt7.88□□□□□ -1.15
TRM8Q12009 ADA2YDR448W 1305 nt7.86□□□□□ -1.15
TRM8Q12009 NBA1YOL070C 1506 nt7.86□□□□□ -1.15
TRM8Q12009 PDC6YGR087C 1692 nt7.86□□□□□ -1.15
TRM8Q12009 AAT1YKL106W 1356 nt7.84□□□□□ -1.15
TRM8Q12009 GDH1YOR375C 1365 nt7.84□□□□□ -1.15
TRM8Q12009 BEM1YBR200W 1656 nt7.84□□□□□ -1.15
TRM8Q12009 MRS4YKR052C 915 nt7.84□□□□□ -1.15
TRM8Q12009 MFT1YML062C 1179 nt7.84□□□□□ -1.15
TRM8Q12009 UTR5YEL035C 501 nt7.83□□□□□ -1.16
TRM8Q12009 RNA170RNA170 169 nt7.83□□□□□ -1.16
TRM8Q12009 LAS17YOR181W 1902 nt7.83□□□□□ -1.16
TRM8Q12009 FRT1YOR324C 1809 nt7.82□□□□□ -1.16
TRM8Q12009 YIR035CYIR035C 765 nt7.82□□□□□ -1.16
TRM8Q12009 ECM27YJR106W 2178 nt7.82□□□□□ -1.16
TRM8Q12009 OLA1YBR025C 1185 nt7.82□□□□□ -1.16
TRM8Q12009 TMS1YDR105C 1422 nt7.81□□□□□ -1.16
TRM8Q12009 TAD2YJL035C 753 nt7.8□□□□□ -1.16
TRM8Q12009 TRP2YER090W 1524 nt7.79□□□□□ -1.16
TRM8Q12009 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt7.79□□□□□ -1.16
TRM8Q12009 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt7.79□□□□□ -1.16
TRM8Q12009 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt7.79□□□□□ -1.16
TRM8Q12009 SUP51tL(UAA)J 84 nt7.79□□□□□ -1.16
TRM8Q12009 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt7.79□□□□□ -1.16
TRM8Q12009 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt7.79□□□□□ -1.16
TRM8Q12009 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt7.79□□□□□ -1.16
TRM8Q12009 YJR149WYJR149W 1215 nt7.79□□□□□ -1.16
TRM8Q12009 BXI1YNL305C 894 nt7.79□□□□□ -1.16
TRM8Q12009 MIM1YOL026C 342 nt7.79□□□□□ -1.16
TRM8Q12009 HDA1YNL021W 2121 nt7.78□□□□□ -1.16
TRM8Q12009 GGC1YDL198C 903 nt7.78□□□□□ -1.16
TRM8Q12009 EDC2YER035W 438 nt7.78□□□□□ -1.16
TRM8Q12009 RPS6AYPL090C 711 nt7.78□□□□□ -1.16
TRM8Q12009 RPS6BYBR181C 711 nt7.78□□□□□ -1.16
TRM8Q12009 ELP4YPL101W 1371 nt7.78□□□□□ -1.16
TRM8Q12009 YPR084WYPR084W 1371 nt7.78□□□□□ -1.16
TRM8Q12009 YEL023CYEL023C 2049 nt7.78□□□□□ -1.16
TRM8Q12009 FET5YFL041W 1869 nt7.77□□□□□ -1.17
TRM8Q12009 COG1YGL223C 1254 nt7.77□□□□□ -1.17
TRM8Q12009 YJL009WYJL009W 327 nt7.77□□□□□ -1.17
TRM8Q12009 YOR268CYOR268C 399 nt7.76□□□□□ -1.17
TRM8Q12009 ATP2YJR121W 1536 nt7.76□□□□□ -1.17
TRM8Q12009 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.75□□□□□ -1.17
TRM8Q12009 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.75□□□□□ -1.17
TRM8Q12009 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.75□□□□□ -1.17
TRM8Q12009 BUB2YMR055C 921 nt7.74□□□□□ -1.17
TRM8Q12009 CTF3YLR381W 2202 nt7.74□□□□□ -1.17
TRM8Q12009 STF1YDL130W-A 261 nt7.73□□□□□ -1.17
TRM8Q12009 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt7.73□□□□□ -1.17
TRM8Q12009 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt7.73□□□□□ -1.17
TRM8Q12009 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt7.73□□□□□ -1.17
TRM8Q12009 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt7.73□□□□□ -1.17
TRM8Q12009 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt7.73□□□□□ -1.17
TRM8Q12009 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt7.73□□□□□ -1.17
TRM8Q12009 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt7.73□□□□□ -1.17
TRM8Q12009 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt7.73□□□□□ -1.17
TRM8Q12009 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt7.73□□□□□ -1.17
TRM8Q12009 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt7.73□□□□□ -1.17
TRM8Q12009 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt7.73□□□□□ -1.17
TRM8Q12009 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt7.73□□□□□ -1.17
TRM8Q12009 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt7.73□□□□□ -1.17
TRM8Q12009 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt7.73□□□□□ -1.17
TRM8Q12009 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt7.73□□□□□ -1.17
TRM8Q12009 FAF1YIL019W 1041 nt7.73□□□□□ -1.17
TRM8Q12009 CCR4YAL021C 2514 nt7.73□□□□□ -1.17
TRM8Q12009 PMA2YPL036W 2844 nt7.72□□□□□ -1.17
TRM8Q12009 YPT31YER031C 672 nt7.72□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.3 ms