Protein–RNA interactions for Protein: Q08729

DSE3, Protein DSE3, yeastyeast

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DSE3Q08729 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt8.97□□□□□ -0.97
DSE3Q08729 SUP51tL(UAA)J 84 nt8.97□□□□□ -0.97
DSE3Q08729 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt8.97□□□□□ -0.97
DSE3Q08729 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt8.97□□□□□ -0.97
DSE3Q08729 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt8.97□□□□□ -0.97
DSE3Q08729 THI73YLR004C 1572 nt8.96□□□□□ -0.97
DSE3Q08729 RPL12BYDR418W 498 nt8.96□□□□□ -0.98
DSE3Q08729 YMR206WYMR206W 942 nt8.96□□□□□ -0.98
DSE3Q08729 MEP1YGR121C 1479 nt8.96□□□□□ -0.98
DSE3Q08729 ELP4YPL101W 1371 nt8.95□□□□□ -0.98
DSE3Q08729 YBR056WYBR056W 1506 nt8.95□□□□□ -0.98
DSE3Q08729 TAD2YJL035C 753 nt8.94□□□□□ -0.98
DSE3Q08729 KAE1YKR038C 1161 nt8.94□□□□□ -0.98
DSE3Q08729 SHC1YER096W 1539 nt8.93□□□□□ -0.98
DSE3Q08729 ATP2YJR121W 1536 nt8.93□□□□□ -0.98
DSE3Q08729 MTO1YGL236C 2010 nt8.93□□□□□ -0.98
DSE3Q08729 snR86snR86 1004 nt8.92□□□□□ -0.98
DSE3Q08729 TOS1YBR162C 1368 nt8.91□□□□□ -0.98
DSE3Q08729 TDH1YJL052W 999 nt8.9□□□□□ -0.98
DSE3Q08729 PUP3YER094C 618 nt8.89□□□□□ -0.99
DSE3Q08729 YIL168WYIL168W 384 nt8.89□□□□□ -0.99
DSE3Q08729 ADE1YAR015W 921 nt8.87□□□□□ -0.99
DSE3Q08729 HEM14YER014W 1620 nt8.86□□□□□ -0.99
DSE3Q08729 RFC1YOR217W 2586 nt8.86□□□□□ -0.99
DSE3Q08729 EHT1YBR177C 1356 nt8.86□□□□□ -0.99
DSE3Q08729 TRP2YER090W 1524 nt8.85□□□□□ -0.99
DSE3Q08729 LRO1YNR008W 1986 nt8.84□□□□□ -0.99
DSE3Q08729 JHD1YER051W 1479 nt8.84□□□□□ -0.99
DSE3Q08729 YJL043WYJL043W 774 nt8.84□□□□□ -0.99
DSE3Q08729 GAL2YLR081W 1725 nt8.83□□□□□ -1
DSE3Q08729 YOR268CYOR268C 399 nt8.83□□□□□ -1
DSE3Q08729 THI6YPL214C 1623 nt8.83□□□□□ -1
DSE3Q08729 HXT8YJL214W 1710 nt8.83□□□□□ -1
DSE3Q08729 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt8.82□□□□□ -1
DSE3Q08729 GTB1YDR221W 2109 nt8.81□□□□□ -1
DSE3Q08729 NUP53YMR153W 1428 nt8.81□□□□□ -1
DSE3Q08729 TIM50YPL063W 1431 nt8.81□□□□□ -1
DSE3Q08729 FET5YFL041W 1869 nt8.81□□□□□ -1
DSE3Q08729 TPO4YOR273C 1980 nt8.81□□□□□ -1
DSE3Q08729 PRE10YOR362C 867 nt8.81□□□□□ -1
DSE3Q08729 HMG2YLR450W 3138 nt8.8□□□□□ -1
DSE3Q08729 EDC2YER035W 438 nt8.79□□□□□ -1
DSE3Q08729 YLR072WYLR072W 2082 nt8.78□□□□□ -1
DSE3Q08729 FUS3YBL016W 1062 nt8.78□□□□□ -1
DSE3Q08729 INO1YJL153C 1602 nt8.77□□□□□ -1.01
DSE3Q08729 PMU1YKL128C 888 nt8.77□□□□□ -1.01
DSE3Q08729 URA8YJR103W 1737 nt8.77□□□□□ -1.01
DSE3Q08729 PET494YNR045W 1470 nt8.77□□□□□ -1.01
DSE3Q08729 MAE1YKL029C 2010 nt8.76□□□□□ -1.01
DSE3Q08729 HXT11YOL156W 1704 nt8.75□□□□□ -1.01
DSE3Q08729 RCF1YML030W 480 nt8.75□□□□□ -1.01
DSE3Q08729 NBA1YOL070C 1506 nt8.75□□□□□ -1.01
DSE3Q08729 HAC1YFL031W 717 nt8.73□□□□□ -1.01
DSE3Q08729 HIS3YOR202W 663 nt8.73□□□□□ -1.01
DSE3Q08729 ABP1YCR088W 1779 nt8.73□□□□□ -1.01
DSE3Q08729 PSP2YML017W 1782 nt8.73□□□□□ -1.01
DSE3Q08729 BUD31YCR063W 474 nt8.72□□□□□ -1.01
DSE3Q08729 RRT6YGL146C 936 nt8.72□□□□□ -1.01
DSE3Q08729 DIP5YPL265W 1827 nt8.72□□□□□ -1.01
DSE3Q08729 NDE2YDL085W 1638 nt8.72□□□□□ -1.01
DSE3Q08729 LEA1YPL213W 717 nt8.71□□□□□ -1.02
DSE3Q08729 TOK1YJL093C 2076 nt8.7□□□□□ -1.02
DSE3Q08729 APT1YML022W 564 nt8.7□□□□□ -1.02
DSE3Q08729 SRM1YGL097W 1449 nt8.7□□□□□ -1.02
DSE3Q08729 YRF1-2YER190W 5046 nt8.69□□□□□ -1.02
DSE3Q08729 WSC3YOL105C 1671 nt8.68□□□□□ -1.02
DSE3Q08729 ARO3YDR035W 1113 nt8.67□□□□□ -1.02
DSE3Q08729 YDR476CYDR476C 675 nt8.67□□□□□ -1.02
DSE3Q08729 ARG7YMR062C 1326 nt8.67□□□□□ -1.02
DSE3Q08729 PNS1YOR161C 1620 nt8.67□□□□□ -1.02
DSE3Q08729 SPR1YOR190W 1338 nt8.67□□□□□ -1.02
DSE3Q08729 BAP3YDR046C 1815 nt8.66□□□□□ -1.02
DSE3Q08729 MFG1YDL233W 1377 nt8.66□□□□□ -1.02
DSE3Q08729 YGR137WYGR137W 375 nt8.66□□□□□ -1.02
DSE3Q08729 TDA4YJR116W 840 nt8.66□□□□□ -1.02
DSE3Q08729 NCA3YJL116C 1014 nt8.65□□□□□ -1.02
DSE3Q08729 YHL008CYHL008C 1884 nt8.64□□□□□ -1.03
DSE3Q08729 ALG7YBR243C 1347 nt8.64□□□□□ -1.03
DSE3Q08729 CPT1YNL130C 1182 nt8.64□□□□□ -1.03
DSE3Q08729 TGL5YOR081C 2250 nt8.64□□□□□ -1.03
DSE3Q08729 MRN1YPL184C 1839 nt8.64□□□□□ -1.03
DSE3Q08729 GLY1YEL046C 1164 nt8.63□□□□□ -1.03
DSE3Q08729 SNP1YIL061C 903 nt8.63□□□□□ -1.03
DSE3Q08729 PRE5YMR314W 705 nt8.63□□□□□ -1.03
DSE3Q08729 MRP7YNL005C 1116 nt8.63□□□□□ -1.03
DSE3Q08729 RSC4YKR008W 1878 nt8.63□□□□□ -1.03
DSE3Q08729 MNN9YPL050C 1188 nt8.62□□□□□ -1.03
DSE3Q08729 WSC4YHL028W 1818 nt8.61□□□□□ -1.03
DSE3Q08729 YLR358CYLR358C 564 nt8.61□□□□□ -1.03
DSE3Q08729 FTH1YBR207W 1398 nt8.61□□□□□ -1.03
DSE3Q08729 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt8.6□□□□□ -1.03
DSE3Q08729 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt8.6□□□□□ -1.03
DSE3Q08729 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt8.6□□□□□ -1.03
DSE3Q08729 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt8.6□□□□□ -1.03
DSE3Q08729 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt8.6□□□□□ -1.03
DSE3Q08729 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt8.6□□□□□ -1.03
DSE3Q08729 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt8.6□□□□□ -1.03
DSE3Q08729 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt8.6□□□□□ -1.03
DSE3Q08729 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt8.6□□□□□ -1.03
DSE3Q08729 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt8.6□□□□□ -1.03
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