Protein–RNA interactions for Protein: Q08646

SSP2, Sporulation-specific protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSP2Q08646 AAC3YBR085W 924 nt9.69□□□□□ -0.86
SSP2Q08646 RRT6YGL146C 936 nt9.68□□□□□ -0.86
SSP2Q08646 YJL009WYJL009W 327 nt9.68□□□□□ -0.86
SSP2Q08646 MDM35YKL053C-A 261 nt9.68□□□□□ -0.86
SSP2Q08646 PUP3YER094C 618 nt9.67□□□□□ -0.86
SSP2Q08646 YMC2YBR104W 990 nt9.67□□□□□ -0.86
SSP2Q08646 YBL095WYBL095W 813 nt9.66□□□□□ -0.86
SSP2Q08646 MRS4YKR052C 915 nt9.65□□□□□ -0.86
SSP2Q08646 YLR358CYLR358C 564 nt9.65□□□□□ -0.86
SSP2Q08646 SHC1YER096W 1539 nt9.65□□□□□ -0.86
SSP2Q08646 PMU1YKL128C 888 nt9.64□□□□□ -0.87
SSP2Q08646 PSP2YML017W 1782 nt9.64□□□□□ -0.87
SSP2Q08646 HAC1YFL031W 717 nt9.63□□□□□ -0.87
SSP2Q08646 RPR1RPR1 369 nt9.62□□□□□ -0.87
SSP2Q08646 JHD1YER051W 1479 nt9.61□□□□□ -0.87
SSP2Q08646 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt9.61□□□□□ -0.87
SSP2Q08646 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt9.61□□□□□ -0.87
SSP2Q08646 YHR218WYHR218W 1812 nt9.61□□□□□ -0.87
SSP2Q08646 TIM50YPL063W 1431 nt9.6□□□□□ -0.87
SSP2Q08646 COS10YNR075W 1125 nt9.6□□□□□ -0.87
SSP2Q08646 PRE10YOR362C 867 nt9.6□□□□□ -0.87
SSP2Q08646 INH1YDL181W 258 nt9.59□□□□□ -0.87
SSP2Q08646 YBR056WYBR056W 1506 nt9.58□□□□□ -0.88
SSP2Q08646 TPN1YGL186C 1740 nt9.57□□□□□ -0.88
SSP2Q08646 YML079WYML079W 606 nt9.57□□□□□ -0.88
SSP2Q08646 MEP1YGR121C 1479 nt9.57□□□□□ -0.88
SSP2Q08646 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt9.56□□□□□ -0.88
SSP2Q08646 CPT1YNL130C 1182 nt9.56□□□□□ -0.88
SSP2Q08646 PNS1YOR161C 1620 nt9.55□□□□□ -0.88
SSP2Q08646 SPR1YOR190W 1338 nt9.55□□□□□ -0.88
SSP2Q08646 Q0010Q0010 387 nt9.53□□□□□ -0.88
SSP2Q08646 MAS1YLR163C 1389 nt9.51□□□□□ -0.89
SSP2Q08646 HXT8YJL214W 1710 nt9.51□□□□□ -0.89
SSP2Q08646 PUP2YGR253C 783 nt9.51□□□□□ -0.89
SSP2Q08646 MCM5YLR274W 2328 nt9.51□□□□□ -0.89
SSP2Q08646 NPP2YEL016C 1482 nt9.51□□□□□ -0.89
SSP2Q08646 DMA2YNL116W 1569 nt9.5□□□□□ -0.89
SSP2Q08646 APT1YML022W 564 nt9.5□□□□□ -0.89
SSP2Q08646 EHT1YBR177C 1356 nt9.5□□□□□ -0.89
SSP2Q08646 NCA3YJL116C 1014 nt9.49□□□□□ -0.89
SSP2Q08646 AAT1YKL106W 1356 nt9.49□□□□□ -0.89
SSP2Q08646 YMR209CYMR209C 1374 nt9.49□□□□□ -0.89
SSP2Q08646 ESBP6YNL125C 2022 nt9.48□□□□□ -0.89
SSP2Q08646 RIM8YGL045W 1629 nt9.48□□□□□ -0.89
SSP2Q08646 LRO1YNR008W 1986 nt9.48□□□□□ -0.89
SSP2Q08646 HXT10YFL011W 1641 nt9.47□□□□□ -0.89
SSP2Q08646 snR86snR86 1004 nt9.47□□□□□ -0.89
SSP2Q08646 RCF1YML030W 480 nt9.46□□□□□ -0.9
SSP2Q08646 YGL114WYGL114W 2178 nt9.44□□□□□ -0.9
SSP2Q08646 NME1NME1 340 nt9.43□□□□□ -0.9
SSP2Q08646 HSL7YBR133C 2484 nt9.43□□□□□ -0.9
SSP2Q08646 AGP3YFL055W 1677 nt9.42□□□□□ -0.9
SSP2Q08646 ARG7YMR062C 1326 nt9.42□□□□□ -0.9
SSP2Q08646 URA1YKL216W 945 nt9.42□□□□□ -0.9
SSP2Q08646 HEL2YDR266C 1920 nt9.41□□□□□ -0.9
SSP2Q08646 PIH1YHR034C 1035 nt9.41□□□□□ -0.9
SSP2Q08646 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt9.41□□□□□ -0.9
SSP2Q08646 SLM3YDL033C 1254 nt9.4□□□□□ -0.9
SSP2Q08646 LAT1YNL071W 1449 nt9.39□□□□□ -0.91
SSP2Q08646 ATP23YNR020C 813 nt9.38□□□□□ -0.91
SSP2Q08646 MTO1YGL236C 2010 nt9.38□□□□□ -0.91
SSP2Q08646 YGR137WYGR137W 375 nt9.37□□□□□ -0.91
SSP2Q08646 YBL111CYBL111C 2004 nt9.36□□□□□ -0.91
SSP2Q08646 CRN1YLR429W 1956 nt9.35□□□□□ -0.91
SSP2Q08646 GID7YCL039W 2238 nt9.35□□□□□ -0.91
SSP2Q08646 INO1YJL153C 1602 nt9.34□□□□□ -0.91
SSP2Q08646 YOX1YML027W 1158 nt9.34□□□□□ -0.91
SSP2Q08646 WSC3YOL105C 1671 nt9.33□□□□□ -0.92
SSP2Q08646 DOC1YGL240W 753 nt9.33□□□□□ -0.92
SSP2Q08646 CYT1YOR065W 930 nt9.33□□□□□ -0.92
SSP2Q08646 NDE2YDL085W 1638 nt9.33□□□□□ -0.92
SSP2Q08646 YRF1-2YER190W 5046 nt9.33□□□□□ -0.92
SSP2Q08646 BUD31YCR063W 474 nt9.32□□□□□ -0.92
SSP2Q08646 ERV2YPR037C 591 nt9.32□□□□□ -0.92
SSP2Q08646 MAS2YHR024C 1449 nt9.31□□□□□ -0.92
SSP2Q08646 MNN9YPL050C 1188 nt9.31□□□□□ -0.92
SSP2Q08646 DIP5YPL265W 1827 nt9.31□□□□□ -0.92
SSP2Q08646 PSD1YNL169C 1503 nt9.31□□□□□ -0.92
SSP2Q08646 STS1YIR011C 960 nt9.3□□□□□ -0.92
SSP2Q08646 YJR142WYJR142W 1029 nt9.3□□□□□ -0.92
SSP2Q08646 YJR154WYJR154W 1041 nt9.3□□□□□ -0.92
SSP2Q08646 TES1YJR019C 1050 nt9.28□□□□□ -0.92
SSP2Q08646 RSC4YKR008W 1878 nt9.28□□□□□ -0.92
SSP2Q08646 NMA2YGR010W 1188 nt9.27□□□□□ -0.93
SSP2Q08646 TDA4YJR116W 840 nt9.27□□□□□ -0.93
SSP2Q08646 MSI1YBR195C 1269 nt9.27□□□□□ -0.93
SSP2Q08646 MET2YNL277W 1461 nt9.27□□□□□ -0.93
SSP2Q08646 UME1YPL139C 1383 nt9.26□□□□□ -0.93
SSP2Q08646 HIS3YOR202W 663 nt9.26□□□□□ -0.93
SSP2Q08646 CKI1YLR133W 1749 nt9.25□□□□□ -0.93
SSP2Q08646 THI6YPL214C 1623 nt9.25□□□□□ -0.93
SSP2Q08646 YGL081WYGL081W 963 nt9.25□□□□□ -0.93
SSP2Q08646 SNP1YIL061C 903 nt9.25□□□□□ -0.93
SSP2Q08646 PTH2YBL057C 627 nt9.25□□□□□ -0.93
SSP2Q08646 TRP2YER090W 1524 nt9.25□□□□□ -0.93
SSP2Q08646 ARO3YDR035W 1113 nt9.24□□□□□ -0.93
SSP2Q08646 YJL144WYJL144W 315 nt9.24□□□□□ -0.93
SSP2Q08646 ALG7YBR243C 1347 nt9.24□□□□□ -0.93
SSP2Q08646 HEM14YER014W 1620 nt9.23□□□□□ -0.93
SSP2Q08646 YDR306CYDR306C 1437 nt9.23□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.7 ms