Protein–RNA interactions for Protein: Q06350

CTS2, Sporulation-specific chitinase 2, yeastyeast

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTS2Q06350 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt7.17□□□□□ -1.26
CTS2Q06350 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt7.17□□□□□ -1.26
CTS2Q06350 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt7.17□□□□□ -1.26
CTS2Q06350 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt7.17□□□□□ -1.26
CTS2Q06350 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt7.17□□□□□ -1.26
CTS2Q06350 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt7.17□□□□□ -1.26
CTS2Q06350 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt7.17□□□□□ -1.26
CTS2Q06350 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt7.17□□□□□ -1.26
CTS2Q06350 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt7.17□□□□□ -1.26
CTS2Q06350 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt7.17□□□□□ -1.26
CTS2Q06350 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt7.17□□□□□ -1.26
CTS2Q06350 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt7.17□□□□□ -1.26
CTS2Q06350 GUT1YHL032C 2130 nt7.17□□□□□ -1.26
CTS2Q06350 AAT1YKL106W 1356 nt7.17□□□□□ -1.26
CTS2Q06350 MET30YIL046W 1923 nt7.17□□□□□ -1.26
CTS2Q06350 YHR131CYHR131C 2553 nt7.15□□□□□ -1.26
CTS2Q06350 YGR210CYGR210C 1236 nt7.15□□□□□ -1.26
CTS2Q06350 YLR460CYLR460C 1131 nt7.15□□□□□ -1.26
CTS2Q06350 SAM50YNL026W 1455 nt7.15□□□□□ -1.27
CTS2Q06350 YLR072WYLR072W 2082 nt7.14□□□□□ -1.27
CTS2Q06350 YBR056WYBR056W 1506 nt7.12□□□□□ -1.27
CTS2Q06350 CHS7YHR142W 951 nt7.12□□□□□ -1.27
CTS2Q06350 BUB2YMR055C 921 nt7.12□□□□□ -1.27
CTS2Q06350 YMR166CYMR166C 1107 nt7.12□□□□□ -1.27
CTS2Q06350 YPL108WYPL108W 507 nt7.12□□□□□ -1.27
CTS2Q06350 HXT11YOL156W 1704 nt7.11□□□□□ -1.27
CTS2Q06350 snR86snR86 1004 nt7.11□□□□□ -1.27
CTS2Q06350 YNL190WYNL190W 615 nt7.11□□□□□ -1.27
CTS2Q06350 MET22YOL064C 1074 nt7.11□□□□□ -1.27
CTS2Q06350 TRP2YER090W 1524 nt7.11□□□□□ -1.27
CTS2Q06350 TGA1tA(UGC)A 73 nt7.1□□□□□ -1.27
CTS2Q06350 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt7.1□□□□□ -1.27
CTS2Q06350 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt7.1□□□□□ -1.27
CTS2Q06350 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt7.1□□□□□ -1.27
CTS2Q06350 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt7.1□□□□□ -1.27
CTS2Q06350 PDC6YGR087C 1692 nt7.09□□□□□ -1.27
CTS2Q06350 HBS1YKR084C 1836 nt7.09□□□□□ -1.27
CTS2Q06350 YJL009WYJL009W 327 nt7.09□□□□□ -1.27
CTS2Q06350 EMC3YKL207W 762 nt7.09□□□□□ -1.27
CTS2Q06350 RNA170RNA170 169 nt7.09□□□□□ -1.27
CTS2Q06350 YMR007WYMR007W 381 nt7.09□□□□□ -1.27
CTS2Q06350 YJR149WYJR149W 1215 nt7.08□□□□□ -1.28
CTS2Q06350 OLA1YBR025C 1185 nt7.08□□□□□ -1.28
CTS2Q06350 OCH1YGL038C 1443 nt7.08□□□□□ -1.28
CTS2Q06350 CAK1YFL029C 1107 nt7.06□□□□□ -1.28
CTS2Q06350 RRT14YIL127C 621 nt7.06□□□□□ -1.28
CTS2Q06350 LSP1YPL004C 1026 nt7.05□□□□□ -1.28
CTS2Q06350 ORT1YOR130C 879 nt7.04□□□□□ -1.28
CTS2Q06350 FCY1YPR062W 477 nt7.04□□□□□ -1.28
CTS2Q06350 YIA6YIL006W 1122 nt7.03□□□□□ -1.28
CTS2Q06350 YJL160CYJL160C 864 nt7.03□□□□□ -1.28
CTS2Q06350 RCR1YBR005W 642 nt7.03□□□□□ -1.28
CTS2Q06350 YMR210WYMR210W 1350 nt7.03□□□□□ -1.28
CTS2Q06350 CBK1YNL161W 2271 nt7.03□□□□□ -1.28
CTS2Q06350 MEP1YGR121C 1479 nt7.03□□□□□ -1.28
CTS2Q06350 SRM1YGL097W 1449 nt7.01□□□□□ -1.29
CTS2Q06350 LAS17YOR181W 1902 nt7.01□□□□□ -1.29
CTS2Q06350 MGM101YJR144W 810 nt7.01□□□□□ -1.29
CTS2Q06350 HIS3YOR202W 663 nt7.01□□□□□ -1.29
CTS2Q06350 EHT1YBR177C 1356 nt7□□□□□ -1.29
CTS2Q06350 LEA1YPL213W 717 nt7□□□□□ -1.29
CTS2Q06350 ABP1YCR088W 1779 nt7□□□□□ -1.29
CTS2Q06350 NDE1YMR145C 1683 nt7□□□□□ -1.29
CTS2Q06350 LRO1YNR008W 1986 nt6.99□□□□□ -1.29
CTS2Q06350 YER156CYER156C 1017 nt6.99□□□□□ -1.29
CTS2Q06350 snR4snR4 186 nt6.99□□□□□ -1.29
CTS2Q06350 FRT1YOR324C 1809 nt6.99□□□□□ -1.29
CTS2Q06350 UBP13YBL067C 2244 nt6.99□□□□□ -1.29
CTS2Q06350 BEM1YBR200W 1656 nt6.98□□□□□ -1.29
CTS2Q06350 PET18YCR020C 648 nt6.98□□□□□ -1.29
CTS2Q06350 BUD31YCR063W 474 nt6.98□□□□□ -1.29
CTS2Q06350 PUP3YER094C 618 nt6.98□□□□□ -1.29
CTS2Q06350 RHO1YPR165W 630 nt6.98□□□□□ -1.29
CTS2Q06350 RIB1YBL033C 1038 nt6.97□□□□□ -1.29
CTS2Q06350 GGC1YDL198C 903 nt6.96□□□□□ -1.3
CTS2Q06350 DIP5YPL265W 1827 nt6.95□□□□□ -1.3
CTS2Q06350 DUS3YLR401C 2007 nt6.95□□□□□ -1.3
CTS2Q06350 YPT31YER031C 672 nt6.95□□□□□ -1.3
CTS2Q06350 RCF1YML030W 480 nt6.95□□□□□ -1.3
CTS2Q06350 POP2YNR052C 1302 nt6.95□□□□□ -1.3
CTS2Q06350 ADE16YLR028C 1776 nt6.95□□□□□ -1.3
CTS2Q06350 NDE2YDL085W 1638 nt6.94□□□□□ -1.3
CTS2Q06350 MLS1YNL117W 1665 nt6.94□□□□□ -1.3
CTS2Q06350 BXI1YNL305C 894 nt6.94□□□□□ -1.3
CTS2Q06350 SHC1YER096W 1539 nt6.93□□□□□ -1.3
CTS2Q06350 GLY1YEL046C 1164 nt6.93□□□□□ -1.3
CTS2Q06350 SOD2YHR008C 702 nt6.93□□□□□ -1.3
CTS2Q06350 TDA4YJR116W 840 nt6.93□□□□□ -1.3
CTS2Q06350 CTF3YLR381W 2202 nt6.92□□□□□ -1.3
CTS2Q06350 THI73YLR004C 1572 nt6.92□□□□□ -1.3
CTS2Q06350 INO1YJL153C 1602 nt6.92□□□□□ -1.3
CTS2Q06350 WSC3YOL105C 1671 nt6.92□□□□□ -1.3
CTS2Q06350 TIF3YPR163C 1311 nt6.92□□□□□ -1.3
CTS2Q06350 YPR084WYPR084W 1371 nt6.92□□□□□ -1.3
CTS2Q06350 ATP2YJR121W 1536 nt6.91□□□□□ -1.3
CTS2Q06350 CCR4YAL021C 2514 nt6.91□□□□□ -1.3
CTS2Q06350 HXT8YJL214W 1710 nt6.91□□□□□ -1.3
CTS2Q06350 TGL5YOR081C 2250 nt6.91□□□□□ -1.3
CTS2Q06350 MFT1YML062C 1179 nt6.91□□□□□ -1.3
CTS2Q06350 RPS6AYPL090C 711 nt6.91□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 54.4 ms