Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SYF1Q04048 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt9.48□□□□□ -0.89
SYF1Q04048 THI73YLR004C 1572 nt9.47□□□□□ -0.89
SYF1Q04048 YIR035CYIR035C 765 nt9.47□□□□□ -0.89
SYF1Q04048 YML079WYML079W 606 nt9.47□□□□□ -0.89
SYF1Q04048 GID7YCL039W 2238 nt9.47□□□□□ -0.89
SYF1Q04048 CWP2YKL096W-A 279 nt9.45□□□□□ -0.9
SYF1Q04048 HAC1YFL031W 717 nt9.44□□□□□ -0.9
SYF1Q04048 PSP2YML017W 1782 nt9.44□□□□□ -0.9
SYF1Q04048 DPL1YDR294C 1770 nt9.43□□□□□ -0.9
SYF1Q04048 PUP2YGR253C 783 nt9.42□□□□□ -0.9
SYF1Q04048 SSL2YIL143C 2532 nt9.41□□□□□ -0.9
SYF1Q04048 HIS2YFR025C 1008 nt9.41□□□□□ -0.9
SYF1Q04048 GPM1YKL152C 744 nt9.41□□□□□ -0.9
SYF1Q04048 UGP1YKL035W 1500 nt9.4□□□□□ -0.91
SYF1Q04048 SHC1YER096W 1539 nt9.39□□□□□ -0.91
SYF1Q04048 BUB2YMR055C 921 nt9.38□□□□□ -0.91
SYF1Q04048 JHD1YER051W 1479 nt9.38□□□□□ -0.91
SYF1Q04048 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt9.37□□□□□ -0.91
SYF1Q04048 PUP3YER094C 618 nt9.37□□□□□ -0.91
SYF1Q04048 PMU1YKL128C 888 nt9.37□□□□□ -0.91
SYF1Q04048 YDR467CYDR467C 327 nt9.36□□□□□ -0.91
SYF1Q04048 URA1YKL216W 945 nt9.36□□□□□ -0.91
SYF1Q04048 TMS1YDR105C 1422 nt9.35□□□□□ -0.91
SYF1Q04048 URA8YJR103W 1737 nt9.35□□□□□ -0.91
SYF1Q04048 CPT1YNL130C 1182 nt9.35□□□□□ -0.91
SYF1Q04048 NCA3YJL116C 1014 nt9.34□□□□□ -0.91
SYF1Q04048 ODC1YPL134C 933 nt9.34□□□□□ -0.91
SYF1Q04048 AAC3YBR085W 924 nt9.34□□□□□ -0.91
SYF1Q04048 PNS1YOR161C 1620 nt9.34□□□□□ -0.91
SYF1Q04048 TIM50YPL063W 1431 nt9.33□□□□□ -0.92
SYF1Q04048 PRE10YOR362C 867 nt9.33□□□□□ -0.92
SYF1Q04048 SPR1YOR190W 1338 nt9.32□□□□□ -0.92
SYF1Q04048 YJL009WYJL009W 327 nt9.32□□□□□ -0.92
SYF1Q04048 LEU4YNL104C 1860 nt9.3□□□□□ -0.92
SYF1Q04048 DOC1YGL240W 753 nt9.3□□□□□ -0.92
SYF1Q04048 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt9.3□□□□□ -0.92
SYF1Q04048 YMC2YBR104W 990 nt9.3□□□□□ -0.92
SYF1Q04048 MEP1YGR121C 1479 nt9.29□□□□□ -0.92
SYF1Q04048 YHR218WYHR218W 1812 nt9.29□□□□□ -0.92
SYF1Q04048 ESBP6YNL125C 2022 nt9.29□□□□□ -0.92
SYF1Q04048 SLM3YDL033C 1254 nt9.28□□□□□ -0.92
SYF1Q04048 MRS4YKR052C 915 nt9.28□□□□□ -0.92
SYF1Q04048 LAT1YNL071W 1449 nt9.28□□□□□ -0.92
SYF1Q04048 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt9.27□□□□□ -0.93
SYF1Q04048 APT1YML022W 564 nt9.27□□□□□ -0.93
SYF1Q04048 PIH1YHR034C 1035 nt9.26□□□□□ -0.93
SYF1Q04048 MAS1YLR163C 1389 nt9.25□□□□□ -0.93
SYF1Q04048 YOX1YML027W 1158 nt9.24□□□□□ -0.93
SYF1Q04048 YBR056WYBR056W 1506 nt9.24□□□□□ -0.93
SYF1Q04048 GTB1YDR221W 2109 nt9.23□□□□□ -0.93
SYF1Q04048 HXT8YJL214W 1710 nt9.23□□□□□ -0.93
SYF1Q04048 MDM35YKL053C-A 261 nt9.23□□□□□ -0.93
SYF1Q04048 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt9.21□□□□□ -0.94
SYF1Q04048 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt9.21□□□□□ -0.94
SYF1Q04048 ATP23YNR020C 813 nt9.21□□□□□ -0.94
SYF1Q04048 YBL111CYBL111C 2004 nt9.21□□□□□ -0.94
SYF1Q04048 TPN1YGL186C 1740 nt9.2□□□□□ -0.94
SYF1Q04048 EHT1YBR177C 1356 nt9.2□□□□□ -0.94
SYF1Q04048 YJL144WYJL144W 315 nt9.19□□□□□ -0.94
SYF1Q04048 MCM5YLR274W 2328 nt9.17□□□□□ -0.94
SYF1Q04048 LRO1YNR008W 1986 nt9.17□□□□□ -0.94
SYF1Q04048 YOR111WYOR111W 699 nt9.16□□□□□ -0.94
SYF1Q04048 INH1YDL181W 258 nt9.15□□□□□ -0.94
SYF1Q04048 CRN1YLR429W 1956 nt9.15□□□□□ -0.95
SYF1Q04048 YHL008CYHL008C 1884 nt9.15□□□□□ -0.95
SYF1Q04048 RFC1YOR217W 2586 nt9.15□□□□□ -0.95
SYF1Q04048 ARG7YMR062C 1326 nt9.14□□□□□ -0.95
SYF1Q04048 MAS2YHR024C 1449 nt9.13□□□□□ -0.95
SYF1Q04048 UME1YPL139C 1383 nt9.12□□□□□ -0.95
SYF1Q04048 ILV2YMR108W 2064 nt9.12□□□□□ -0.95
SYF1Q04048 NPP2YEL016C 1482 nt9.11□□□□□ -0.95
SYF1Q04048 CYS3YAL012W 1185 nt9.11□□□□□ -0.95
SYF1Q04048 SRY1YKL218C 981 nt9.11□□□□□ -0.95
SYF1Q04048 RCF1YML030W 480 nt9.11□□□□□ -0.95
SYF1Q04048 AAT1YKL106W 1356 nt9.11□□□□□ -0.95
SYF1Q04048 YJR142WYJR142W 1029 nt9.1□□□□□ -0.95
SYF1Q04048 MCP1YOR228C 909 nt9.1□□□□□ -0.95
SYF1Q04048 ERV2YPR037C 591 nt9.1□□□□□ -0.95
SYF1Q04048 snR86snR86 1004 nt9.09□□□□□ -0.95
SYF1Q04048 PTH2YBL057C 627 nt9.09□□□□□ -0.95
SYF1Q04048 CKI1YLR133W 1749 nt9.08□□□□□ -0.96
SYF1Q04048 NMA2YGR010W 1188 nt9.08□□□□□ -0.96
SYF1Q04048 YPQ1YOL092W 927 nt9.08□□□□□ -0.96
SYF1Q04048 AIM46YHR199C 933 nt9.07□□□□□ -0.96
SYF1Q04048 YMR209CYMR209C 1374 nt9.07□□□□□ -0.96
SYF1Q04048 STS1YIR011C 960 nt9.06□□□□□ -0.96
SYF1Q04048 PUS4YNL292W 1212 nt9.06□□□□□ -0.96
SYF1Q04048 MSI1YBR195C 1269 nt9.05□□□□□ -0.96
SYF1Q04048 TES1YJR019C 1050 nt9.04□□□□□ -0.96
SYF1Q04048 Q0010Q0010 387 nt9.04□□□□□ -0.96
SYF1Q04048 HEM14YER014W 1620 nt9.04□□□□□ -0.96
SYF1Q04048 DMA2YNL116W 1569 nt9.03□□□□□ -0.96
SYF1Q04048 HXT10YFL011W 1641 nt9.03□□□□□ -0.96
SYF1Q04048 YGR137WYGR137W 375 nt9.03□□□□□ -0.96
SYF1Q04048 ADH6YMR318C 1083 nt9.03□□□□□ -0.96
SYF1Q04048 MNN9YPL050C 1188 nt9.03□□□□□ -0.96
SYF1Q04048 YGL081WYGL081W 963 nt9.02□□□□□ -0.97
SYF1Q04048 YPL067CYPL067C 597 nt9.02□□□□□ -0.97
SYF1Q04048 SPE3YPR069C 882 nt9.02□□□□□ -0.97
SYF1Q04048 SPG1YGR236C 288 nt9.01□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 44.8 ms