Protein–RNA interactions for Protein: Q01454

CTF4, DNA polymerase alpha-binding protein, yeastyeast

Predictions only

Length 927 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTF4Q01454 YJL009WYJL009W 327 nt10.02□□□□□ -0.81
CTF4Q01454 LEU4YNL104C 1860 nt10.02□□□□□ -0.81
CTF4Q01454 FUS3YBL016W 1062 nt10.01□□□□□ -0.81
CTF4Q01454 MDM35YKL053C-A 261 nt10□□□□□ -0.81
CTF4Q01454 MET2YNL277W 1461 nt9.99□□□□□ -0.81
CTF4Q01454 ATP2YJR121W 1536 nt9.99□□□□□ -0.81
CTF4Q01454 BUB2YMR055C 921 nt9.99□□□□□ -0.81
CTF4Q01454 NUP53YMR153W 1428 nt9.99□□□□□ -0.81
CTF4Q01454 MRS4YKR052C 915 nt9.98□□□□□ -0.81
CTF4Q01454 YBL095WYBL095W 813 nt9.98□□□□□ -0.81
CTF4Q01454 TMS1YDR105C 1422 nt9.96□□□□□ -0.82
CTF4Q01454 INH1YDL181W 258 nt9.94□□□□□ -0.82
CTF4Q01454 AAC3YBR085W 924 nt9.94□□□□□ -0.82
CTF4Q01454 YDR476CYDR476C 675 nt9.93□□□□□ -0.82
CTF4Q01454 MCM5YLR274W 2328 nt9.92□□□□□ -0.82
CTF4Q01454 RIM8YGL045W 1629 nt9.92□□□□□ -0.82
CTF4Q01454 YMR209CYMR209C 1374 nt9.9□□□□□ -0.82
CTF4Q01454 PUP3YER094C 618 nt9.9□□□□□ -0.82
CTF4Q01454 HSL7YBR133C 2484 nt9.9□□□□□ -0.83
CTF4Q01454 SHC1YER096W 1539 nt9.89□□□□□ -0.83
CTF4Q01454 YPL247CYPL247C 1572 nt9.88□□□□□ -0.83
CTF4Q01454 TPN1YGL186C 1740 nt9.88□□□□□ -0.83
CTF4Q01454 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt9.88□□□□□ -0.83
CTF4Q01454 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt9.88□□□□□ -0.83
CTF4Q01454 RRT6YGL146C 936 nt9.88□□□□□ -0.83
CTF4Q01454 HEL2YDR266C 1920 nt9.88□□□□□ -0.83
CTF4Q01454 PMU1YKL128C 888 nt9.87□□□□□ -0.83
CTF4Q01454 PRE10YOR362C 867 nt9.87□□□□□ -0.83
CTF4Q01454 DMA2YNL116W 1569 nt9.87□□□□□ -0.83
CTF4Q01454 MEP1YGR121C 1479 nt9.86□□□□□ -0.83
CTF4Q01454 YLR358CYLR358C 564 nt9.86□□□□□ -0.83
CTF4Q01454 YHR218WYHR218W 1812 nt9.86□□□□□ -0.83
CTF4Q01454 JHD1YER051W 1479 nt9.85□□□□□ -0.83
CTF4Q01454 PSP2YML017W 1782 nt9.84□□□□□ -0.83
CTF4Q01454 HAC1YFL031W 717 nt9.84□□□□□ -0.83
CTF4Q01454 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt9.84□□□□□ -0.83
CTF4Q01454 AAT1YKL106W 1356 nt9.83□□□□□ -0.84
CTF4Q01454 NPP2YEL016C 1482 nt9.83□□□□□ -0.84
CTF4Q01454 GTB1YDR221W 2109 nt9.83□□□□□ -0.84
CTF4Q01454 HXT10YFL011W 1641 nt9.82□□□□□ -0.84
CTF4Q01454 YBR056WYBR056W 1506 nt9.82□□□□□ -0.84
CTF4Q01454 TIM50YPL063W 1431 nt9.82□□□□□ -0.84
CTF4Q01454 YGL114WYGL114W 2178 nt9.8□□□□□ -0.84
CTF4Q01454 RSC4YKR008W 1878 nt9.79□□□□□ -0.84
CTF4Q01454 YML079WYML079W 606 nt9.78□□□□□ -0.84
CTF4Q01454 CYT1YOR065W 930 nt9.77□□□□□ -0.85
CTF4Q01454 PNS1YOR161C 1620 nt9.77□□□□□ -0.85
CTF4Q01454 SPR1YOR190W 1338 nt9.77□□□□□ -0.85
CTF4Q01454 snR86snR86 1004 nt9.76□□□□□ -0.85
CTF4Q01454 CPT1YNL130C 1182 nt9.76□□□□□ -0.85
CTF4Q01454 COS10YNR075W 1125 nt9.76□□□□□ -0.85
CTF4Q01454 EHT1YBR177C 1356 nt9.75□□□□□ -0.85
CTF4Q01454 RPR1RPR1 369 nt9.75□□□□□ -0.85
CTF4Q01454 HXT8YJL214W 1710 nt9.75□□□□□ -0.85
CTF4Q01454 GAL2YLR081W 1725 nt9.74□□□□□ -0.85
CTF4Q01454 TOK1YJL093C 2076 nt9.74□□□□□ -0.85
CTF4Q01454 AGP3YFL055W 1677 nt9.74□□□□□ -0.85
CTF4Q01454 APT1YML022W 564 nt9.73□□□□□ -0.85
CTF4Q01454 YGR139WYGR139W 339 nt9.72□□□□□ -0.85
CTF4Q01454 NCA3YJL116C 1014 nt9.72□□□□□ -0.85
CTF4Q01454 MAS1YLR163C 1389 nt9.72□□□□□ -0.85
CTF4Q01454 LRO1YNR008W 1986 nt9.72□□□□□ -0.85
CTF4Q01454 RCF1YML030W 480 nt9.71□□□□□ -0.86
CTF4Q01454 MTO1YGL236C 2010 nt9.71□□□□□ -0.86
CTF4Q01454 PSD1YNL169C 1503 nt9.71□□□□□ -0.86
CTF4Q01454 YGR137WYGR137W 375 nt9.69□□□□□ -0.86
CTF4Q01454 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt9.68□□□□□ -0.86
CTF4Q01454 INO1YJL153C 1602 nt9.67□□□□□ -0.86
CTF4Q01454 ARG7YMR062C 1326 nt9.67□□□□□ -0.86
CTF4Q01454 HMG2YLR450W 3138 nt9.66□□□□□ -0.86
CTF4Q01454 PUP2YGR253C 783 nt9.66□□□□□ -0.86
CTF4Q01454 NDE2YDL085W 1638 nt9.65□□□□□ -0.86
CTF4Q01454 MNN9YPL050C 1188 nt9.64□□□□□ -0.87
CTF4Q01454 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt9.61□□□□□ -0.87
CTF4Q01454 WSC3YOL105C 1671 nt9.61□□□□□ -0.87
CTF4Q01454 TPO4YOR273C 1980 nt9.6□□□□□ -0.87
CTF4Q01454 TRP2YER090W 1524 nt9.58□□□□□ -0.88
CTF4Q01454 BUD31YCR063W 474 nt9.58□□□□□ -0.88
CTF4Q01454 URA1YKL216W 945 nt9.58□□□□□ -0.88
CTF4Q01454 MAS2YHR024C 1449 nt9.56□□□□□ -0.88
CTF4Q01454 THI6YPL214C 1623 nt9.56□□□□□ -0.88
CTF4Q01454 SNP1YIL061C 903 nt9.56□□□□□ -0.88
CTF4Q01454 YBL111CYBL111C 2004 nt9.56□□□□□ -0.88
CTF4Q01454 URA8YJR103W 1737 nt9.56□□□□□ -0.88
CTF4Q01454 SLM3YDL033C 1254 nt9.55□□□□□ -0.88
CTF4Q01454 STS1YIR011C 960 nt9.55□□□□□ -0.88
CTF4Q01454 DOC1YGL240W 753 nt9.54□□□□□ -0.88
CTF4Q01454 PIH1YHR034C 1035 nt9.54□□□□□ -0.88
CTF4Q01454 TDA4YJR116W 840 nt9.54□□□□□ -0.88
CTF4Q01454 ATP23YNR020C 813 nt9.54□□□□□ -0.88
CTF4Q01454 HIS3YOR202W 663 nt9.54□□□□□ -0.88
CTF4Q01454 ERV2YPR037C 591 nt9.54□□□□□ -0.88
CTF4Q01454 LAT1YNL071W 1449 nt9.54□□□□□ -0.88
CTF4Q01454 YOX1YML027W 1158 nt9.53□□□□□ -0.88
CTF4Q01454 MRP7YNL005C 1116 nt9.53□□□□□ -0.88
CTF4Q01454 DIP5YPL265W 1827 nt9.53□□□□□ -0.88
CTF4Q01454 FRA1YLL029W 2250 nt9.53□□□□□ -0.88
CTF4Q01454 TES1YJR019C 1050 nt9.52□□□□□ -0.89
CTF4Q01454 YJR142WYJR142W 1029 nt9.52□□□□□ -0.89
CTF4Q01454 ARO3YDR035W 1113 nt9.51□□□□□ -0.89
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