Protein–RNA interactions for Protein: P63316

TNNC1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC1P63316 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNNC1P63316 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNNC1P63316 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNNC1P63316 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNNC1P63316 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNNC1P63316 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNNC1P63316 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNNC1P63316 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNNC1P63316 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNNC1P63316 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNNC1P63316 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNNC1P63316 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNNC1P63316 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TNNC1P63316 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNNC1P63316 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNNC1P63316 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNNC1P63316 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNNC1P63316 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNNC1P63316 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TNNC1P63316 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNNC1P63316 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNNC1P63316 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNNC1P63316 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNNC1P63316 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TNNC1P63316 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNNC1P63316 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNNC1P63316 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNNC1P63316 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNNC1P63316 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNNC1P63316 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNNC1P63316 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNNC1P63316 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNNC1P63316 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNNC1P63316 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNNC1P63316 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNNC1P63316 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNNC1P63316 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNNC1P63316 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNNC1P63316 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNNC1P63316 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNNC1P63316 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNNC1P63316 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNNC1P63316 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNNC1P63316 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNNC1P63316 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNNC1P63316 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNNC1P63316 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNNC1P63316 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNNC1P63316 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNNC1P63316 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TNNC1P63316 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TNNC1P63316 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNNC1P63316 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNNC1P63316 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNNC1P63316 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNNC1P63316 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNNC1P63316 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNNC1P63316 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNNC1P63316 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNNC1P63316 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
TNNC1P63316 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNNC1P63316 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNNC1P63316 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNNC1P63316 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNNC1P63316 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNNC1P63316 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNNC1P63316 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNNC1P63316 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNNC1P63316 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNNC1P63316 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNNC1P63316 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNNC1P63316 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNNC1P63316 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNNC1P63316 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TNNC1P63316 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNNC1P63316 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNNC1P63316 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNNC1P63316 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TNNC1P63316 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TNNC1P63316 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TNNC1P63316 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNNC1P63316 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNNC1P63316 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNNC1P63316 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TNNC1P63316 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNNC1P63316 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNNC1P63316 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TNNC1P63316 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNNC1P63316 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TNNC1P63316 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TNNC1P63316 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TNNC1P63316 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNNC1P63316 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNNC1P63316 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNNC1P63316 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNNC1P63316 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TNNC1P63316 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
TNNC1P63316 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNNC1P63316 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNNC1P63316 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms