Protein–RNA interactions for Protein: P36104

SWD2, COMPASS component SWD2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SWD2P36104 PHB2YGR231C 933 nt6.88□□□□□ -1.31
SWD2P36104 FLX1YIL134W 936 nt6.88□□□□□ -1.31
SWD2P36104 YJR149WYJR149W 1215 nt6.88□□□□□ -1.31
SWD2P36104 LPD1YFL018C 1500 nt6.87□□□□□ -1.31
SWD2P36104 DIA4YHR011W 1341 nt6.87□□□□□ -1.31
SWD2P36104 LYS20YDL182W 1287 nt6.87□□□□□ -1.31
SWD2P36104 CYC3YAL039C 810 nt6.87□□□□□ -1.31
SWD2P36104 POP2YNR052C 1302 nt6.86□□□□□ -1.31
SWD2P36104 PAU19YMR325W 375 nt6.86□□□□□ -1.31
SWD2P36104 ADE16YLR028C 1776 nt6.86□□□□□ -1.31
SWD2P36104 YIR035CYIR035C 765 nt6.85□□□□□ -1.31
SWD2P36104 BUB2YMR055C 921 nt6.85□□□□□ -1.31
SWD2P36104 YIL177CYIL177C 5277 nt6.84□□□□□ -1.32
SWD2P36104 YFR020WYFR020W 699 nt6.83□□□□□ -1.32
SWD2P36104 SNU66YOR308C 1764 nt6.82□□□□□ -1.32
SWD2P36104 SRP102YKL154W 735 nt6.81□□□□□ -1.32
SWD2P36104 YLR280CYLR280C 351 nt6.81□□□□□ -1.32
SWD2P36104 YLR460CYLR460C 1131 nt6.81□□□□□ -1.32
SWD2P36104 INO1YJL153C 1602 nt6.79□□□□□ -1.32
SWD2P36104 BUD31YCR063W 474 nt6.79□□□□□ -1.32
SWD2P36104 NDE2YDL085W 1638 nt6.79□□□□□ -1.32
SWD2P36104 TIF3YPR163C 1311 nt6.78□□□□□ -1.32
SWD2P36104 GLY1YEL046C 1164 nt6.78□□□□□ -1.32
SWD2P36104 PFS2YNL317W 1398 nt6.78□□□□□ -1.32
SWD2P36104 MRN1YPL184C 1839 nt6.78□□□□□ -1.32
SWD2P36104 ERO1YML130C 1692 nt6.77□□□□□ -1.32
SWD2P36104 ALR1YOL130W 2580 nt6.77□□□□□ -1.33
SWD2P36104 RNA170RNA170 169 nt6.77□□□□□ -1.33
SWD2P36104 YNL140CYNL140C 570 nt6.77□□□□□ -1.33
SWD2P36104 MDH2YOL126C 1134 nt6.77□□□□□ -1.33
SWD2P36104 PUP1YOR157C 786 nt6.77□□□□□ -1.33
SWD2P36104 ADE2YOR128C 1716 nt6.76□□□□□ -1.33
SWD2P36104 SER2YGR208W 930 nt6.76□□□□□ -1.33
SWD2P36104 DIP5YPL265W 1827 nt6.76□□□□□ -1.33
SWD2P36104 HTS1YPR033C 1641 nt6.76□□□□□ -1.33
SWD2P36104 HSV2YGR223C 1347 nt6.76□□□□□ -1.33
SWD2P36104 TGL5YOR081C 2250 nt6.75□□□□□ -1.33
SWD2P36104 LRO1YNR008W 1986 nt6.75□□□□□ -1.33
SWD2P36104 EHT1YBR177C 1356 nt6.75□□□□□ -1.33
SWD2P36104 INM1YHR046C 888 nt6.75□□□□□ -1.33
SWD2P36104 CHS7YHR142W 951 nt6.74□□□□□ -1.33
SWD2P36104 MET22YOL064C 1074 nt6.74□□□□□ -1.33
SWD2P36104 OLA1YBR025C 1185 nt6.74□□□□□ -1.33
SWD2P36104 TDA4YJR116W 840 nt6.73□□□□□ -1.33
SWD2P36104 PMT7YDR307W 1989 nt6.73□□□□□ -1.33
SWD2P36104 NAS6YGR232W 687 nt6.72□□□□□ -1.33
SWD2P36104 SLG1YOR008C 1137 nt6.72□□□□□ -1.33
SWD2P36104 FCY1YPR062W 477 nt6.72□□□□□ -1.33
SWD2P36104 RTG2YGL252C 1767 nt6.72□□□□□ -1.33
SWD2P36104 MET30YIL046W 1923 nt6.72□□□□□ -1.33
SWD2P36104 WSC4YHL028W 1818 nt6.71□□□□□ -1.33
SWD2P36104 YCP4YCR004C 744 nt6.71□□□□□ -1.34
SWD2P36104 TGA1tA(UGC)A 73 nt6.71□□□□□ -1.34
SWD2P36104 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt6.71□□□□□ -1.34
SWD2P36104 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt6.71□□□□□ -1.34
SWD2P36104 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt6.71□□□□□ -1.34
SWD2P36104 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt6.71□□□□□ -1.34
SWD2P36104 YGR210CYGR210C 1236 nt6.71□□□□□ -1.34
SWD2P36104 YNL190WYNL190W 615 nt6.71□□□□□ -1.34
SWD2P36104 TOM71YHR117W 1920 nt6.7□□□□□ -1.34
SWD2P36104 MGM101YJR144W 810 nt6.7□□□□□ -1.34
SWD2P36104 SAM50YNL026W 1455 nt6.7□□□□□ -1.34
SWD2P36104 SLM3YDL033C 1254 nt6.69□□□□□ -1.34
SWD2P36104 YJL045WYJL045W 1905 nt6.69□□□□□ -1.34
SWD2P36104 YRF1-1YDR545W 5391 nt6.69□□□□□ -1.34
SWD2P36104 YRF1-5YLR467W 5391 nt6.69□□□□□ -1.34
SWD2P36104 YRF1-8YOR396W 5391 nt6.69□□□□□ -1.34
SWD2P36104 PDC6YGR087C 1692 nt6.68□□□□□ -1.34
SWD2P36104 ARO3YDR035W 1113 nt6.68□□□□□ -1.34
SWD2P36104 MRP7YNL005C 1116 nt6.68□□□□□ -1.34
SWD2P36104 ALG7YBR243C 1347 nt6.68□□□□□ -1.34
SWD2P36104 KTR4YBR199W 1395 nt6.68□□□□□ -1.34
SWD2P36104 MLS1YNL117W 1665 nt6.68□□□□□ -1.34
SWD2P36104 MET13YGL125W 1803 nt6.67□□□□□ -1.34
SWD2P36104 RPL2AYFR031C-A 765 nt6.67□□□□□ -1.34
SWD2P36104 RCF1YML030W 480 nt6.67□□□□□ -1.34
SWD2P36104 YMR166CYMR166C 1107 nt6.67□□□□□ -1.34
SWD2P36104 LAS17YOR181W 1902 nt6.67□□□□□ -1.34
SWD2P36104 OCH1YGL038C 1443 nt6.67□□□□□ -1.34
SWD2P36104 WSC3YOL105C 1671 nt6.66□□□□□ -1.34
SWD2P36104 LSP1YPL004C 1026 nt6.66□□□□□ -1.34
SWD2P36104 SHC1YER096W 1539 nt6.66□□□□□ -1.34
SWD2P36104 YMR007WYMR007W 381 nt6.65□□□□□ -1.34
SWD2P36104 RCR1YBR005W 642 nt6.65□□□□□ -1.34
SWD2P36104 YPL108WYPL108W 507 nt6.65□□□□□ -1.34
SWD2P36104 RHO1YPR165W 630 nt6.65□□□□□ -1.34
SWD2P36104 CBK1YNL161W 2271 nt6.64□□□□□ -1.35
SWD2P36104 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt6.63□□□□□ -1.35
SWD2P36104 PUP3YER094C 618 nt6.63□□□□□ -1.35
SWD2P36104 CAK1YFL029C 1107 nt6.63□□□□□ -1.35
SWD2P36104 ELP6YMR312W 822 nt6.63□□□□□ -1.35
SWD2P36104 HXT8YJL214W 1710 nt6.62□□□□□ -1.35
SWD2P36104 THI73YLR004C 1572 nt6.62□□□□□ -1.35
SWD2P36104 YPT31YER031C 672 nt6.62□□□□□ -1.35
SWD2P36104 YGR137WYGR137W 375 nt6.62□□□□□ -1.35
SWD2P36104 YEL023CYEL023C 2049 nt6.62□□□□□ -1.35
SWD2P36104 PMT1YDL095W 2454 nt6.61□□□□□ -1.35
SWD2P36104 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt6.61□□□□□ -1.35
SWD2P36104 RRT14YIL127C 621 nt6.61□□□□□ -1.35
SWD2P36104 AIM34YMR003W 597 nt6.61□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 19.6 ms