Protein–RNA interactions for Protein: P34220

YBL055C, Deoxyribonuclease Tat-D, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YBL055CP34220 ADE16YLR028C 1776 nt8.4□□□□□ -1.06
YBL055CP34220 GAL2YLR081W 1725 nt8.4□□□□□ -1.06
YBL055CP34220 YGR210CYGR210C 1236 nt8.4□□□□□ -1.06
YBL055CP34220 CHS7YHR142W 951 nt8.39□□□□□ -1.07
YBL055CP34220 HIS3YOR202W 663 nt8.39□□□□□ -1.07
YBL055CP34220 HEM14YER014W 1620 nt8.39□□□□□ -1.07
YBL055CP34220 TGA1tA(UGC)A 73 nt8.38□□□□□ -1.07
YBL055CP34220 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt8.38□□□□□ -1.07
YBL055CP34220 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt8.38□□□□□ -1.07
YBL055CP34220 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt8.38□□□□□ -1.07
YBL055CP34220 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt8.38□□□□□ -1.07
YBL055CP34220 PUP1YOR157C 786 nt8.38□□□□□ -1.07
YBL055CP34220 HTS1YPR033C 1641 nt8.37□□□□□ -1.07
YBL055CP34220 OLA1YBR025C 1185 nt8.37□□□□□ -1.07
YBL055CP34220 DTR1YBR180W 1719 nt8.37□□□□□ -1.07
YBL055CP34220 RFC1YOR217W 2586 nt8.36□□□□□ -1.07
YBL055CP34220 DIA4YHR011W 1341 nt8.35□□□□□ -1.07
YBL055CP34220 OCH1YGL038C 1443 nt8.35□□□□□ -1.07
YBL055CP34220 PDC6YGR087C 1692 nt8.34□□□□□ -1.07
YBL055CP34220 INO1YJL153C 1602 nt8.34□□□□□ -1.07
YBL055CP34220 YMR166CYMR166C 1107 nt8.34□□□□□ -1.07
YBL055CP34220 CAK1YFL029C 1107 nt8.33□□□□□ -1.08
YBL055CP34220 SLG1YOR008C 1137 nt8.33□□□□□ -1.08
YBL055CP34220 TOK1YJL093C 2076 nt8.33□□□□□ -1.08
YBL055CP34220 LSP1YPL004C 1026 nt8.32□□□□□ -1.08
YBL055CP34220 YPL108WYPL108W 507 nt8.32□□□□□ -1.08
YBL055CP34220 EHT1YBR177C 1356 nt8.32□□□□□ -1.08
YBL055CP34220 LRO1YNR008W 1986 nt8.31□□□□□ -1.08
YBL055CP34220 BUD31YCR063W 474 nt8.31□□□□□ -1.08
YBL055CP34220 FCY1YPR062W 477 nt8.31□□□□□ -1.08
YBL055CP34220 NDE2YDL085W 1638 nt8.3□□□□□ -1.08
YBL055CP34220 PFS2YNL317W 1398 nt8.3□□□□□ -1.08
YBL055CP34220 SAM50YNL026W 1455 nt8.3□□□□□ -1.08
YBL055CP34220 SWM1YDR260C 513 nt8.29□□□□□ -1.08
YBL055CP34220 YRF1-3YGR296W 5580 nt8.29□□□□□ -1.08
YBL055CP34220 YRF1-6YNL339C 5580 nt8.29□□□□□ -1.08
YBL055CP34220 YRF1-7YPL283C 5580 nt8.29□□□□□ -1.08
YBL055CP34220 RHO1YPR165W 630 nt8.28□□□□□ -1.08
YBL055CP34220 YIL177CYIL177C 5277 nt8.27□□□□□ -1.08
YBL055CP34220 DIP5YPL265W 1827 nt8.27□□□□□ -1.09
YBL055CP34220 YCP4YCR004C 744 nt8.27□□□□□ -1.09
YBL055CP34220 GLY1YEL046C 1164 nt8.27□□□□□ -1.09
YBL055CP34220 RRT14YIL127C 621 nt8.27□□□□□ -1.09
YBL055CP34220 HSV2YGR223C 1347 nt8.27□□□□□ -1.09
YBL055CP34220 TIF3YPR163C 1311 nt8.27□□□□□ -1.09
YBL055CP34220 MRN1YPL184C 1839 nt8.26□□□□□ -1.09
YBL055CP34220 LPD1YFL018C 1500 nt8.26□□□□□ -1.09
YBL055CP34220 YNL140CYNL140C 570 nt8.26□□□□□ -1.09
YBL055CP34220 MDH2YOL126C 1134 nt8.26□□□□□ -1.09
YBL055CP34220 THI73YLR004C 1572 nt8.26□□□□□ -1.09
YBL055CP34220 SHC1YER096W 1539 nt8.25□□□□□ -1.09
YBL055CP34220 TGL5YOR081C 2250 nt8.25□□□□□ -1.09
YBL055CP34220 RSC4YKR008W 1878 nt8.25□□□□□ -1.09
YBL055CP34220 TDA4YJR116W 840 nt8.24□□□□□ -1.09
YBL055CP34220 PUP3YER094C 618 nt8.23□□□□□ -1.09
YBL055CP34220 INM1YHR046C 888 nt8.23□□□□□ -1.09
YBL055CP34220 RCF1YML030W 480 nt8.23□□□□□ -1.09
YBL055CP34220 HXT8YJL214W 1710 nt8.21□□□□□ -1.09
YBL055CP34220 PET18YCR020C 648 nt8.21□□□□□ -1.1
YBL055CP34220 YPT31YER031C 672 nt8.21□□□□□ -1.1
YBL055CP34220 YRF1-1YDR545W 5391 nt8.21□□□□□ -1.1
YBL055CP34220 YRF1-5YLR467W 5391 nt8.21□□□□□ -1.1
YBL055CP34220 YRF1-8YOR396W 5391 nt8.21□□□□□ -1.1
YBL055CP34220 WSC4YHL028W 1818 nt8.2□□□□□ -1.1
YBL055CP34220 SLM3YDL033C 1254 nt8.2□□□□□ -1.1
YBL055CP34220 ARO3YDR035W 1113 nt8.2□□□□□ -1.1
YBL055CP34220 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt8.2□□□□□ -1.1
YBL055CP34220 YJL160CYJL160C 864 nt8.2□□□□□ -1.1
YBL055CP34220 WSC3YOL105C 1671 nt8.2□□□□□ -1.1
YBL055CP34220 YMR007WYMR007W 381 nt8.19□□□□□ -1.1
YBL055CP34220 MRP7YNL005C 1116 nt8.19□□□□□ -1.1
YBL055CP34220 BXI1YNL305C 894 nt8.18□□□□□ -1.1
YBL055CP34220 PMT7YDR307W 1989 nt8.18□□□□□ -1.1
YBL055CP34220 ALG7YBR243C 1347 nt8.18□□□□□ -1.1
YBL055CP34220 YGR137WYGR137W 375 nt8.17□□□□□ -1.1
YBL055CP34220 YDR306CYDR306C 1437 nt8.16□□□□□ -1.1
YBL055CP34220 RPS6AYPL090C 711 nt8.16□□□□□ -1.1
YBL055CP34220 RPS6BYBR181C 711 nt8.16□□□□□ -1.1
YBL055CP34220 KTR4YBR199W 1395 nt8.14□□□□□ -1.11
YBL055CP34220 YER156CYER156C 1017 nt8.14□□□□□ -1.11
YBL055CP34220 TIM50YPL063W 1431 nt8.13□□□□□ -1.11
YBL055CP34220 PRE10YOR362C 867 nt8.13□□□□□ -1.11
YBL055CP34220 MET30YIL046W 1923 nt8.12□□□□□ -1.11
YBL055CP34220 SNP1YIL061C 903 nt8.12□□□□□ -1.11
YBL055CP34220 RCR1YBR005W 642 nt8.12□□□□□ -1.11
YBL055CP34220 JHD1YER051W 1479 nt8.12□□□□□ -1.11
YBL055CP34220 AIM34YMR003W 597 nt8.11□□□□□ -1.11
YBL055CP34220 YMR206WYMR206W 942 nt8.11□□□□□ -1.11
YBL055CP34220 YPR084WYPR084W 1371 nt8.1□□□□□ -1.11
YBL055CP34220 UTR5YEL035C 501 nt8.1□□□□□ -1.11
YBL055CP34220 ELP6YMR312W 822 nt8.1□□□□□ -1.11
YBL055CP34220 YNL190WYNL190W 615 nt8.1□□□□□ -1.11
YBL055CP34220 Q0010Q0010 387 nt8.1□□□□□ -1.11
YBL055CP34220 MTC6YHR151C 1581 nt8.1□□□□□ -1.11
YBL055CP34220 ATP2YJR121W 1536 nt8.08□□□□□ -1.12
YBL055CP34220 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt8.08□□□□□ -1.12
YBL055CP34220 YPL264CYPL264C 1062 nt8.08□□□□□ -1.12
YBL055CP34220 RPL2AYFR031C-A 765 nt8.07□□□□□ -1.12
YBL055CP34220 MFT1YML062C 1179 nt8.07□□□□□ -1.12
YBL055CP34220 PMU1YKL128C 888 nt8.06□□□□□ -1.12
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