Protein–RNA interactions for Protein: P32340

NDI1, Rotenone-insensitive NADH-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NDI1P32340 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt8.09□□□□□ -1.11
NDI1P32340 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt8.09□□□□□ -1.11
NDI1P32340 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt8.09□□□□□ -1.11
NDI1P32340 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt8.09□□□□□ -1.11
NDI1P32340 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt8.09□□□□□ -1.11
NDI1P32340 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt8.09□□□□□ -1.11
NDI1P32340 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt8.09□□□□□ -1.11
NDI1P32340 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt8.09□□□□□ -1.11
NDI1P32340 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt8.09□□□□□ -1.11
NDI1P32340 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt8.09□□□□□ -1.11
NDI1P32340 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt8.09□□□□□ -1.11
NDI1P32340 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt8.09□□□□□ -1.11
NDI1P32340 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt8.09□□□□□ -1.11
NDI1P32340 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt8.09□□□□□ -1.11
NDI1P32340 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt8.09□□□□□ -1.11
NDI1P32340 RRT14YIL127C 621 nt8.09□□□□□ -1.11
NDI1P32340 FCY1YPR062W 477 nt8.09□□□□□ -1.11
NDI1P32340 LSP1YPL004C 1026 nt8.08□□□□□ -1.12
NDI1P32340 YIA6YIL006W 1122 nt8.07□□□□□ -1.12
NDI1P32340 YMR210WYMR210W 1350 nt8.06□□□□□ -1.12
NDI1P32340 HBS1YKR084C 1836 nt8.06□□□□□ -1.12
NDI1P32340 MIM1YOL026C 342 nt8.05□□□□□ -1.12
NDI1P32340 MDL2YPL270W 2322 nt8.04□□□□□ -1.12
NDI1P32340 MEP1YGR121C 1479 nt8.04□□□□□ -1.12
NDI1P32340 YJL160CYJL160C 864 nt8.03□□□□□ -1.12
NDI1P32340 HIS3YOR202W 663 nt8.03□□□□□ -1.12
NDI1P32340 DUR3YHL016C 2208 nt8.02□□□□□ -1.13
NDI1P32340 LEA1YPL213W 717 nt8.02□□□□□ -1.13
NDI1P32340 RHO1YPR165W 630 nt8.02□□□□□ -1.13
NDI1P32340 RIB1YBL033C 1038 nt8.01□□□□□ -1.13
NDI1P32340 SRM1YGL097W 1449 nt8.01□□□□□ -1.13
NDI1P32340 YPT31YER031C 672 nt8□□□□□ -1.13
NDI1P32340 PUP3YER094C 618 nt8□□□□□ -1.13
NDI1P32340 EHT1YBR177C 1356 nt7.99□□□□□ -1.13
NDI1P32340 BUD31YCR063W 474 nt7.99□□□□□ -1.13
NDI1P32340 YER156CYER156C 1017 nt7.99□□□□□ -1.13
NDI1P32340 RCF1YML030W 480 nt7.99□□□□□ -1.13
NDI1P32340 NDE2YDL085W 1638 nt7.99□□□□□ -1.13
NDI1P32340 ORT1YOR130C 879 nt7.98□□□□□ -1.13
NDI1P32340 Q0010Q0010 387 nt7.98□□□□□ -1.13
NDI1P32340 LRO1YNR008W 1986 nt7.98□□□□□ -1.13
NDI1P32340 ABP1YCR088W 1779 nt7.97□□□□□ -1.13
NDI1P32340 PET18YCR020C 648 nt7.97□□□□□ -1.13
NDI1P32340 SOD2YHR008C 702 nt7.97□□□□□ -1.13
NDI1P32340 YPR084WYPR084W 1371 nt7.97□□□□□ -1.13
NDI1P32340 PUS7YOR243C 2031 nt7.96□□□□□ -1.13
NDI1P32340 THI73YLR004C 1572 nt7.96□□□□□ -1.14
NDI1P32340 TDA4YJR116W 840 nt7.95□□□□□ -1.14
NDI1P32340 INO1YJL153C 1602 nt7.95□□□□□ -1.14
NDI1P32340 YGR137WYGR137W 375 nt7.94□□□□□ -1.14
NDI1P32340 MFT1YML062C 1179 nt7.94□□□□□ -1.14
NDI1P32340 BXI1YNL305C 894 nt7.94□□□□□ -1.14
NDI1P32340 WSC3YOL105C 1671 nt7.94□□□□□ -1.14
NDI1P32340 TIF3YPR163C 1311 nt7.94□□□□□ -1.14
NDI1P32340 TGL5YOR081C 2250 nt7.93□□□□□ -1.14
NDI1P32340 GLY1YEL046C 1164 nt7.93□□□□□ -1.14
NDI1P32340 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt7.93□□□□□ -1.14
NDI1P32340 YMR206WYMR206W 942 nt7.93□□□□□ -1.14
NDI1P32340 DIP5YPL265W 1827 nt7.93□□□□□ -1.14
NDI1P32340 GNP1YDR508C 1992 nt7.93□□□□□ -1.14
NDI1P32340 SHC1YER096W 1539 nt7.93□□□□□ -1.14
NDI1P32340 PMU1YKL128C 888 nt7.92□□□□□ -1.14
NDI1P32340 YNL140CYNL140C 570 nt7.92□□□□□ -1.14
NDI1P32340 RPS6AYPL090C 711 nt7.92□□□□□ -1.14
NDI1P32340 RPS6BYBR181C 711 nt7.92□□□□□ -1.14
NDI1P32340 FRA1YLL029W 2250 nt7.92□□□□□ -1.14
NDI1P32340 DUS3YLR401C 2007 nt7.91□□□□□ -1.14
NDI1P32340 INM1YHR046C 888 nt7.91□□□□□ -1.14
NDI1P32340 PRE10YOR362C 867 nt7.91□□□□□ -1.14
NDI1P32340 ATP2YJR121W 1536 nt7.9□□□□□ -1.14
NDI1P32340 TIM50YPL063W 1431 nt7.9□□□□□ -1.14
NDI1P32340 FTH1YBR207W 1398 nt7.9□□□□□ -1.14
NDI1P32340 FIT1YDR534C 1587 nt7.89□□□□□ -1.15
NDI1P32340 ERG6YML008C 1152 nt7.89□□□□□ -1.15
NDI1P32340 HXT8YJL214W 1710 nt7.89□□□□□ -1.15
NDI1P32340 ADA2YDR448W 1305 nt7.86□□□□□ -1.15
NDI1P32340 DIA4YHR011W 1341 nt7.86□□□□□ -1.15
NDI1P32340 snR4snR4 186 nt7.86□□□□□ -1.15
NDI1P32340 MRN1YPL184C 1839 nt7.85□□□□□ -1.15
NDI1P32340 POP2YNR052C 1302 nt7.85□□□□□ -1.15
NDI1P32340 UTR5YEL035C 501 nt7.85□□□□□ -1.15
NDI1P32340 JHD1YER051W 1479 nt7.85□□□□□ -1.15
NDI1P32340 UFD1YGR048W 1086 nt7.84□□□□□ -1.15
NDI1P32340 YJR154WYJR154W 1041 nt7.84□□□□□ -1.15
NDI1P32340 MRP7YNL005C 1116 nt7.84□□□□□ -1.15
NDI1P32340 WSC4YHL028W 1818 nt7.84□□□□□ -1.15
NDI1P32340 ALR1YOL130W 2580 nt7.84□□□□□ -1.15
NDI1P32340 TOM71YHR117W 1920 nt7.84□□□□□ -1.16
NDI1P32340 ALG7YBR243C 1347 nt7.83□□□□□ -1.16
NDI1P32340 GRH1YDR517W 1119 nt7.83□□□□□ -1.16
NDI1P32340 ARO3YDR035W 1113 nt7.82□□□□□ -1.16
NDI1P32340 MRP1YDR347W 966 nt7.82□□□□□ -1.16
NDI1P32340 GDH1YOR375C 1365 nt7.82□□□□□ -1.16
NDI1P32340 YER152W-AYER152W-A 567 nt7.81□□□□□ -1.16
NDI1P32340 TAD2YJL035C 753 nt7.81□□□□□ -1.16
NDI1P32340 KTR4YBR199W 1395 nt7.81□□□□□ -1.16
NDI1P32340 ARG7YMR062C 1326 nt7.8□□□□□ -1.16
NDI1P32340 TDH1YJL052W 999 nt7.8□□□□□ -1.16
NDI1P32340 NME1NME1 340 nt7.79□□□□□ -1.16
NDI1P32340 ADE16YLR028C 1776 nt7.79□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.5 ms