Protein–RNA interactions for Protein: P25367

RNQ1, [PIN+] prion protein RNQ1, yeastyeast

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RNQ1P25367 SUP51tL(UAA)J 84 nt7.75□□□□□ -1.17
RNQ1P25367 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt7.75□□□□□ -1.17
RNQ1P25367 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt7.75□□□□□ -1.17
RNQ1P25367 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt7.75□□□□□ -1.17
RNQ1P25367 YJR154WYJR154W 1041 nt7.75□□□□□ -1.17
RNQ1P25367 AST1YBL069W 1290 nt7.75□□□□□ -1.17
RNQ1P25367 YOR268CYOR268C 399 nt7.75□□□□□ -1.17
RNQ1P25367 YPL041CYPL041C 624 nt7.75□□□□□ -1.17
RNQ1P25367 SBP1YHL034C 885 nt7.74□□□□□ -1.17
RNQ1P25367 YJR149WYJR149W 1215 nt7.74□□□□□ -1.17
RNQ1P25367 MOD5YOR274W 1287 nt7.74□□□□□ -1.17
RNQ1P25367 ADA2YDR448W 1305 nt7.74□□□□□ -1.17
RNQ1P25367 HXT10YFL011W 1641 nt7.74□□□□□ -1.17
RNQ1P25367 GDH1YOR375C 1365 nt7.73□□□□□ -1.17
RNQ1P25367 PEX27YOR193W 1131 nt7.73□□□□□ -1.17
RNQ1P25367 DPL1YDR294C 1770 nt7.73□□□□□ -1.17
RNQ1P25367 PHO92YDR374C 921 nt7.72□□□□□ -1.17
RNQ1P25367 CAK1YFL029C 1107 nt7.72□□□□□ -1.17
RNQ1P25367 RPC31YNL151C 756 nt7.72□□□□□ -1.17
RNQ1P25367 FTH1YBR207W 1398 nt7.71□□□□□ -1.17
RNQ1P25367 YHL044WYHL044W 708 nt7.71□□□□□ -1.18
RNQ1P25367 YLR036CYLR036C 612 nt7.71□□□□□ -1.18
RNQ1P25367 CYT1YOR065W 930 nt7.71□□□□□ -1.18
RNQ1P25367 YGL118CYGL118C 438 nt7.7□□□□□ -1.18
RNQ1P25367 SFP1YLR403W 2052 nt7.69□□□□□ -1.18
RNQ1P25367 YHP1YDR451C 1062 nt7.69□□□□□ -1.18
RNQ1P25367 EDC2YER035W 438 nt7.69□□□□□ -1.18
RNQ1P25367 COG1YGL223C 1254 nt7.69□□□□□ -1.18
RNQ1P25367 RRT14YIL127C 621 nt7.69□□□□□ -1.18
RNQ1P25367 MFT1YML062C 1179 nt7.69□□□□□ -1.18
RNQ1P25367 OCH1YGL038C 1443 nt7.69□□□□□ -1.18
RNQ1P25367 YER156CYER156C 1017 nt7.68□□□□□ -1.18
RNQ1P25367 YML079WYML079W 606 nt7.68□□□□□ -1.18
RNQ1P25367 MET22YOL064C 1074 nt7.68□□□□□ -1.18
RNQ1P25367 ELP4YPL101W 1371 nt7.68□□□□□ -1.18
RNQ1P25367 YHL008CYHL008C 1884 nt7.67□□□□□ -1.18
RNQ1P25367 MPC1YGL080W 393 nt7.67□□□□□ -1.18
RNQ1P25367 YLR460CYLR460C 1131 nt7.67□□□□□ -1.18
RNQ1P25367 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt7.67□□□□□ -1.18
RNQ1P25367 RPS6AYPL090C 711 nt7.67□□□□□ -1.18
RNQ1P25367 RPS6BYBR181C 711 nt7.67□□□□□ -1.18
RNQ1P25367 MFG1YDL233W 1377 nt7.67□□□□□ -1.18
RNQ1P25367 PIC2YER053C 903 nt7.66□□□□□ -1.18
RNQ1P25367 TAD2YJL035C 753 nt7.66□□□□□ -1.18
RNQ1P25367 TOS1YBR162C 1368 nt7.66□□□□□ -1.18
RNQ1P25367 AGP3YFL055W 1677 nt7.66□□□□□ -1.18
RNQ1P25367 PAB1YER165W 1734 nt7.66□□□□□ -1.18
RNQ1P25367 BXI1YNL305C 894 nt7.65□□□□□ -1.18
RNQ1P25367 THI3YDL080C 1830 nt7.64□□□□□ -1.19
RNQ1P25367 KRR1YCL059C 951 nt7.64□□□□□ -1.19
RNQ1P25367 UBC12YLR306W 567 nt7.64□□□□□ -1.19
RNQ1P25367 LEU4YNL104C 1860 nt7.64□□□□□ -1.19
RNQ1P25367 CHS7YHR142W 951 nt7.63□□□□□ -1.19
RNQ1P25367 ARC19YKL013C 516 nt7.63□□□□□ -1.19
RNQ1P25367 RNA170RNA170 169 nt7.63□□□□□ -1.19
RNQ1P25367 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt7.63□□□□□ -1.19
RNQ1P25367 MET2YNL277W 1461 nt7.62□□□□□ -1.19
RNQ1P25367 MPS2YGL075C 1164 nt7.62□□□□□ -1.19
RNQ1P25367 BNS1YGR230W 414 nt7.62□□□□□ -1.19
RNQ1P25367 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt7.62□□□□□ -1.19
RNQ1P25367 YMR206WYMR206W 942 nt7.62□□□□□ -1.19
RNQ1P25367 GGA2YHR108W 1758 nt7.61□□□□□ -1.19
RNQ1P25367 PDC6YGR087C 1692 nt7.61□□□□□ -1.19
RNQ1P25367 ADE1YAR015W 921 nt7.61□□□□□ -1.19
RNQ1P25367 YBL081WYBL081W 1107 nt7.61□□□□□ -1.19
RNQ1P25367 GTT3YEL017W 1014 nt7.6□□□□□ -1.19
RNQ1P25367 COX3Q0275 810 nt7.59□□□□□ -1.19
RNQ1P25367 OLA1YBR025C 1185 nt7.59□□□□□ -1.19
RNQ1P25367 MRPL36YBR122C 534 nt7.59□□□□□ -1.19
RNQ1P25367 HMG2YLR450W 3138 nt7.59□□□□□ -1.19
RNQ1P25367 YPR084WYPR084W 1371 nt7.59□□□□□ -1.2
RNQ1P25367 YJL043WYJL043W 774 nt7.58□□□□□ -1.2
RNQ1P25367 FAR3YMR052W 615 nt7.58□□□□□ -1.2
RNQ1P25367 NAT5YOR253W 531 nt7.58□□□□□ -1.2
RNQ1P25367 BNA3YJL060W 1335 nt7.57□□□□□ -1.2
RNQ1P25367 GPM1YKL152C 744 nt7.57□□□□□ -1.2
RNQ1P25367 YTH1YPR107C 627 nt7.57□□□□□ -1.2
RNQ1P25367 HOS2YGL194C 1359 nt7.57□□□□□ -1.2
RNQ1P25367 ATP2YJR121W 1536 nt7.57□□□□□ -1.2
RNQ1P25367 BAP3YDR046C 1815 nt7.57□□□□□ -1.2
RNQ1P25367 HOG1YLR113W 1308 nt7.56□□□□□ -1.2
RNQ1P25367 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.56□□□□□ -1.2
RNQ1P25367 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.56□□□□□ -1.2
RNQ1P25367 TDH1YJL052W 999 nt7.56□□□□□ -1.2
RNQ1P25367 AIM41YOR215C 558 nt7.56□□□□□ -1.2
RNQ1P25367 NPP2YEL016C 1482 nt7.55□□□□□ -1.2
RNQ1P25367 FUS3YBL016W 1062 nt7.55□□□□□ -1.2
RNQ1P25367 YNL234WYNL234W 1281 nt7.55□□□□□ -1.2
RNQ1P25367 TPO4YOR273C 1980 nt7.55□□□□□ -1.2
RNQ1P25367 PET494YNR045W 1470 nt7.55□□□□□ -1.2
RNQ1P25367 YIL168WYIL168W 384 nt7.54□□□□□ -1.2
RNQ1P25367 RUF21RUF21 707 nt7.54□□□□□ -1.2
RNQ1P25367 VPS28YPL065W 729 nt7.54□□□□□ -1.2
RNQ1P25367 NPP1YCR026C 2229 nt7.54□□□□□ -1.2
RNQ1P25367 NUP53YMR153W 1428 nt7.53□□□□□ -1.2
RNQ1P25367 INH1YDL181W 258 nt7.53□□□□□ -1.2
RNQ1P25367 YDR467CYDR467C 327 nt7.53□□□□□ -1.2
RNQ1P25367 YPT31YER031C 672 nt7.53□□□□□ -1.2
RNQ1P25367 REC114YMR133W 1287 nt7.53□□□□□ -1.2
RNQ1P25367 PRE5YMR314W 705 nt7.53□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.6 ms