Protein–RNA interactions for Protein: P21912

SDHB, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHBP21912 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SDHBP21912 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SDHBP21912 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SDHBP21912 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SDHBP21912 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SDHBP21912 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SDHBP21912 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SDHBP21912 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SDHBP21912 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SDHBP21912 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SDHBP21912 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SDHBP21912 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SDHBP21912 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SDHBP21912 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SDHBP21912 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SDHBP21912 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SDHBP21912 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SDHBP21912 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SDHBP21912 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SDHBP21912 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SDHBP21912 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SDHBP21912 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SDHBP21912 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SDHBP21912 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SDHBP21912 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SDHBP21912 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SDHBP21912 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SDHBP21912 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SDHBP21912 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SDHBP21912 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SDHBP21912 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SDHBP21912 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SDHBP21912 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SDHBP21912 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SDHBP21912 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SDHBP21912 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SDHBP21912 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SDHBP21912 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SDHBP21912 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SDHBP21912 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SDHBP21912 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SDHBP21912 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SDHBP21912 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SDHBP21912 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SDHBP21912 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SDHBP21912 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SDHBP21912 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SDHBP21912 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SDHBP21912 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SDHBP21912 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SDHBP21912 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SDHBP21912 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SDHBP21912 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SDHBP21912 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SDHBP21912 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SDHBP21912 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SDHBP21912 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SDHBP21912 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SDHBP21912 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SDHBP21912 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SDHBP21912 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SDHBP21912 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SDHBP21912 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDHBP21912 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDHBP21912 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDHBP21912 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDHBP21912 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SDHBP21912 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SDHBP21912 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SDHBP21912 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SDHBP21912 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SDHBP21912 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SDHBP21912 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SDHBP21912 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SDHBP21912 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SDHBP21912 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SDHBP21912 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SDHBP21912 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SDHBP21912 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SDHBP21912 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SDHBP21912 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SDHBP21912 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SDHBP21912 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SDHBP21912 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SDHBP21912 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SDHBP21912 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SDHBP21912 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SDHBP21912 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SDHBP21912 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SDHBP21912 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SDHBP21912 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SDHBP21912 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SDHBP21912 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SDHBP21912 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SDHBP21912 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SDHBP21912 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SDHBP21912 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SDHBP21912 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SDHBP21912 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SDHBP21912 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms