Protein–RNA interactions for Protein: P20823

HNF1A, Hepatocyte nuclear factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF1AP20823 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HNF1AP20823 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HNF1AP20823 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HNF1AP20823 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HNF1AP20823 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HNF1AP20823 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HNF1AP20823 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HNF1AP20823 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HNF1AP20823 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HNF1AP20823 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HNF1AP20823 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HNF1AP20823 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HNF1AP20823 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HNF1AP20823 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HNF1AP20823 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HNF1AP20823 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HNF1AP20823 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HNF1AP20823 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HNF1AP20823 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HNF1AP20823 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HNF1AP20823 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HNF1AP20823 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HNF1AP20823 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HNF1AP20823 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HNF1AP20823 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HNF1AP20823 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HNF1AP20823 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
HNF1AP20823 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HNF1AP20823 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HNF1AP20823 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HNF1AP20823 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HNF1AP20823 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HNF1AP20823 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HNF1AP20823 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
HNF1AP20823 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HNF1AP20823 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
HNF1AP20823 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HNF1AP20823 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HNF1AP20823 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HNF1AP20823 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HNF1AP20823 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HNF1AP20823 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HNF1AP20823 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HNF1AP20823 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HNF1AP20823 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HNF1AP20823 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HNF1AP20823 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HNF1AP20823 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HNF1AP20823 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HNF1AP20823 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HNF1AP20823 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HNF1AP20823 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HNF1AP20823 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HNF1AP20823 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HNF1AP20823 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HNF1AP20823 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HNF1AP20823 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HNF1AP20823 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HNF1AP20823 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HNF1AP20823 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HNF1AP20823 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HNF1AP20823 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HNF1AP20823 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HNF1AP20823 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
HNF1AP20823 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HNF1AP20823 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HNF1AP20823 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HNF1AP20823 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HNF1AP20823 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HNF1AP20823 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HNF1AP20823 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HNF1AP20823 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HNF1AP20823 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HNF1AP20823 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HNF1AP20823 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HNF1AP20823 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HNF1AP20823 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HNF1AP20823 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HNF1AP20823 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HNF1AP20823 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HNF1AP20823 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HNF1AP20823 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HNF1AP20823 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HNF1AP20823 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HNF1AP20823 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HNF1AP20823 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HNF1AP20823 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HNF1AP20823 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HNF1AP20823 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HNF1AP20823 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HNF1AP20823 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HNF1AP20823 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HNF1AP20823 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HNF1AP20823 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HNF1AP20823 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HNF1AP20823 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HNF1AP20823 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HNF1AP20823 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HNF1AP20823 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HNF1AP20823 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms