Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NGFRP08138 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NGFRP08138 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NGFRP08138 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NGFRP08138 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NGFRP08138 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NGFRP08138 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NGFRP08138 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NGFRP08138 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NGFRP08138 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NGFRP08138 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NGFRP08138 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NGFRP08138 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NGFRP08138 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NGFRP08138 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NGFRP08138 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NGFRP08138 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NGFRP08138 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NGFRP08138 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NGFRP08138 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NGFRP08138 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NGFRP08138 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NGFRP08138 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NGFRP08138 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NGFRP08138 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NGFRP08138 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NGFRP08138 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NGFRP08138 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NGFRP08138 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NGFRP08138 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NGFRP08138 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NGFRP08138 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NGFRP08138 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NGFRP08138 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NGFRP08138 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NGFRP08138 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NGFRP08138 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NGFRP08138 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NGFRP08138 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NGFRP08138 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NGFRP08138 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NGFRP08138 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NGFRP08138 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NGFRP08138 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NGFRP08138 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NGFRP08138 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NGFRP08138 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NGFRP08138 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NGFRP08138 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NGFRP08138 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NGFRP08138 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NGFRP08138 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NGFRP08138 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NGFRP08138 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NGFRP08138 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NGFRP08138 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NGFRP08138 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NGFRP08138 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NGFRP08138 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NGFRP08138 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NGFRP08138 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NGFRP08138 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NGFRP08138 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NGFRP08138 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NGFRP08138 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NGFRP08138 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NGFRP08138 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NGFRP08138 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NGFRP08138 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NGFRP08138 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NGFRP08138 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NGFRP08138 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NGFRP08138 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NGFRP08138 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NGFRP08138 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NGFRP08138 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NGFRP08138 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NGFRP08138 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NGFRP08138 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NGFRP08138 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NGFRP08138 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NGFRP08138 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NGFRP08138 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NGFRP08138 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NGFRP08138 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NGFRP08138 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NGFRP08138 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NGFRP08138 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NGFRP08138 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NGFRP08138 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NGFRP08138 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NGFRP08138 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NGFRP08138 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NGFRP08138 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NGFRP08138 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NGFRP08138 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NGFRP08138 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NGFRP08138 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NGFRP08138 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NGFRP08138 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms