Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
F9P00740 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
F9P00740 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
F9P00740 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
F9P00740 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
F9P00740 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
F9P00740 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
F9P00740 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
F9P00740 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
F9P00740 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
F9P00740 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
F9P00740 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
F9P00740 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
F9P00740 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
F9P00740 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
F9P00740 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
F9P00740 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
F9P00740 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
F9P00740 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
F9P00740 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
F9P00740 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
F9P00740 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
F9P00740 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
F9P00740 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
F9P00740 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
F9P00740 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
F9P00740 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
F9P00740 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
F9P00740 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
F9P00740 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
F9P00740 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
F9P00740 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
F9P00740 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
F9P00740 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
F9P00740 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
F9P00740 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
F9P00740 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
F9P00740 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
F9P00740 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
F9P00740 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
F9P00740 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
F9P00740 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
F9P00740 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
F9P00740 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
F9P00740 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
F9P00740 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
F9P00740 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
F9P00740 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
F9P00740 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
F9P00740 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
F9P00740 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
F9P00740 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
F9P00740 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
F9P00740 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
F9P00740 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
F9P00740 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
F9P00740 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
F9P00740 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
F9P00740 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
F9P00740 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
F9P00740 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
F9P00740 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
F9P00740 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
F9P00740 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
F9P00740 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
F9P00740 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
F9P00740 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
F9P00740 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
F9P00740 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
F9P00740 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
F9P00740 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
F9P00740 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
F9P00740 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
F9P00740 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
F9P00740 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
F9P00740 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
F9P00740 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
F9P00740 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
F9P00740 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
F9P00740 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
F9P00740 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
F9P00740 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
F9P00740 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
F9P00740 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
F9P00740 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
F9P00740 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
F9P00740 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
F9P00740 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
F9P00740 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
F9P00740 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
F9P00740 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
F9P00740 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
F9P00740 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
F9P00740 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
F9P00740 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
F9P00740 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
F9P00740 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
F9P00740 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
F9P00740 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
F9P00740 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms