Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vti1bO88384 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vti1bO88384 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vti1bO88384 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vti1bO88384 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vti1bO88384 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vti1bO88384 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vti1bO88384 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vti1bO88384 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vti1bO88384 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Vti1bO88384 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vti1bO88384 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vti1bO88384 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vti1bO88384 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vti1bO88384 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vti1bO88384 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Vti1bO88384 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vti1bO88384 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vti1bO88384 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vti1bO88384 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vti1bO88384 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vti1bO88384 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vti1bO88384 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vti1bO88384 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vti1bO88384 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vti1bO88384 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vti1bO88384 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vti1bO88384 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vti1bO88384 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vti1bO88384 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vti1bO88384 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vti1bO88384 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vti1bO88384 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vti1bO88384 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vti1bO88384 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vti1bO88384 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vti1bO88384 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vti1bO88384 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vti1bO88384 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vti1bO88384 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vti1bO88384 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vti1bO88384 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vti1bO88384 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vti1bO88384 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vti1bO88384 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vti1bO88384 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vti1bO88384 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vti1bO88384 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vti1bO88384 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vti1bO88384 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vti1bO88384 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vti1bO88384 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vti1bO88384 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vti1bO88384 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Vti1bO88384 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vti1bO88384 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vti1bO88384 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vti1bO88384 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vti1bO88384 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vti1bO88384 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vti1bO88384 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vti1bO88384 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vti1bO88384 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vti1bO88384 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vti1bO88384 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vti1bO88384 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vti1bO88384 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vti1bO88384 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vti1bO88384 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vti1bO88384 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vti1bO88384 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vti1bO88384 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vti1bO88384 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vti1bO88384 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vti1bO88384 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vti1bO88384 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vti1bO88384 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vti1bO88384 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vti1bO88384 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vti1bO88384 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vti1bO88384 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vti1bO88384 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Vti1bO88384 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vti1bO88384 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vti1bO88384 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vti1bO88384 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vti1bO88384 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vti1bO88384 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vti1bO88384 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vti1bO88384 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vti1bO88384 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Vti1bO88384 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vti1bO88384 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Vti1bO88384 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vti1bO88384 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vti1bO88384 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vti1bO88384 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vti1bO88384 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vti1bO88384 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vti1bO88384 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms