Protein–RNA interactions for Protein: O75197

LRP5, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5O75197 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
LRP5O75197 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
LRP5O75197 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
LRP5O75197 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
LRP5O75197 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
LRP5O75197 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
LRP5O75197 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
LRP5O75197 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
LRP5O75197 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
LRP5O75197 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
LRP5O75197 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
LRP5O75197 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
LRP5O75197 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
LRP5O75197 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
LRP5O75197 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
LRP5O75197 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC33.57■■■□□ 2.97
LRP5O75197 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
LRP5O75197 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
LRP5O75197 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
LRP5O75197 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
LRP5O75197 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
LRP5O75197 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
LRP5O75197 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
LRP5O75197 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
LRP5O75197 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
LRP5O75197 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
LRP5O75197 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
LRP5O75197 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
LRP5O75197 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
LRP5O75197 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
LRP5O75197 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
LRP5O75197 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
LRP5O75197 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
LRP5O75197 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
LRP5O75197 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
LRP5O75197 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
LRP5O75197 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
LRP5O75197 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
LRP5O75197 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
LRP5O75197 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
LRP5O75197 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
LRP5O75197 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
LRP5O75197 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
LRP5O75197 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
LRP5O75197 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
LRP5O75197 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
LRP5O75197 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
LRP5O75197 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
LRP5O75197 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
LRP5O75197 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
LRP5O75197 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
LRP5O75197 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
LRP5O75197 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
LRP5O75197 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
LRP5O75197 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
LRP5O75197 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
LRP5O75197 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
LRP5O75197 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
LRP5O75197 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
LRP5O75197 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
LRP5O75197 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
LRP5O75197 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
LRP5O75197 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
LRP5O75197 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
LRP5O75197 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
LRP5O75197 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
LRP5O75197 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
LRP5O75197 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
LRP5O75197 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
LRP5O75197 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
LRP5O75197 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
LRP5O75197 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
LRP5O75197 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
LRP5O75197 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
LRP5O75197 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
LRP5O75197 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
LRP5O75197 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC33.29■■■□□ 2.92
LRP5O75197 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
LRP5O75197 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
LRP5O75197 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
LRP5O75197 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
LRP5O75197 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
LRP5O75197 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
LRP5O75197 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC33.28■■■□□ 2.92
LRP5O75197 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
LRP5O75197 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
LRP5O75197 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
LRP5O75197 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
LRP5O75197 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
LRP5O75197 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
LRP5O75197 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
LRP5O75197 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
LRP5O75197 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
LRP5O75197 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
LRP5O75197 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
LRP5O75197 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
LRP5O75197 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
LRP5O75197 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
LRP5O75197 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
LRP5O75197 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms