Protein–RNA interactions for Protein: O70589

Cask, Peripheral plasma membrane protein CASK, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaskO70589 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CaskO70589 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CaskO70589 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CaskO70589 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CaskO70589 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CaskO70589 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CaskO70589 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CaskO70589 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CaskO70589 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CaskO70589 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CaskO70589 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CaskO70589 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CaskO70589 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CaskO70589 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CaskO70589 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CaskO70589 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CaskO70589 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CaskO70589 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CaskO70589 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CaskO70589 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CaskO70589 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CaskO70589 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CaskO70589 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CaskO70589 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CaskO70589 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CaskO70589 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CaskO70589 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CaskO70589 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CaskO70589 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CaskO70589 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CaskO70589 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CaskO70589 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CaskO70589 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CaskO70589 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CaskO70589 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CaskO70589 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CaskO70589 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CaskO70589 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CaskO70589 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CaskO70589 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CaskO70589 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CaskO70589 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CaskO70589 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CaskO70589 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CaskO70589 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CaskO70589 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CaskO70589 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CaskO70589 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CaskO70589 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CaskO70589 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CaskO70589 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CaskO70589 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CaskO70589 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CaskO70589 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CaskO70589 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CaskO70589 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CaskO70589 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CaskO70589 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CaskO70589 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CaskO70589 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CaskO70589 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CaskO70589 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CaskO70589 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CaskO70589 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CaskO70589 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CaskO70589 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CaskO70589 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CaskO70589 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CaskO70589 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CaskO70589 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CaskO70589 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CaskO70589 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CaskO70589 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CaskO70589 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CaskO70589 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CaskO70589 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CaskO70589 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CaskO70589 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CaskO70589 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CaskO70589 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CaskO70589 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CaskO70589 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CaskO70589 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CaskO70589 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CaskO70589 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CaskO70589 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CaskO70589 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CaskO70589 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CaskO70589 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CaskO70589 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CaskO70589 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CaskO70589 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CaskO70589 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CaskO70589 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CaskO70589 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CaskO70589 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CaskO70589 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CaskO70589 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CaskO70589 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CaskO70589 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms