Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GATCO43716 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GATCO43716 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GATCO43716 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GATCO43716 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GATCO43716 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GATCO43716 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GATCO43716 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GATCO43716 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GATCO43716 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GATCO43716 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GATCO43716 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GATCO43716 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GATCO43716 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GATCO43716 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
GATCO43716 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GATCO43716 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GATCO43716 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GATCO43716 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GATCO43716 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
GATCO43716 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GATCO43716 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
GATCO43716 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GATCO43716 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
GATCO43716 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GATCO43716 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GATCO43716 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
GATCO43716 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
GATCO43716 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GATCO43716 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GATCO43716 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
GATCO43716 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
GATCO43716 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GATCO43716 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GATCO43716 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GATCO43716 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
GATCO43716 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
GATCO43716 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GATCO43716 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GATCO43716 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
GATCO43716 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
GATCO43716 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GATCO43716 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GATCO43716 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GATCO43716 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GATCO43716 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
GATCO43716 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
GATCO43716 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GATCO43716 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GATCO43716 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GATCO43716 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GATCO43716 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GATCO43716 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GATCO43716 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GATCO43716 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GATCO43716 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GATCO43716 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
GATCO43716 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GATCO43716 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GATCO43716 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GATCO43716 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GATCO43716 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GATCO43716 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GATCO43716 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GATCO43716 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GATCO43716 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GATCO43716 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GATCO43716 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GATCO43716 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GATCO43716 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GATCO43716 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GATCO43716 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GATCO43716 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
GATCO43716 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GATCO43716 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GATCO43716 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GATCO43716 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GATCO43716 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GATCO43716 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
GATCO43716 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GATCO43716 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GATCO43716 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GATCO43716 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GATCO43716 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GATCO43716 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GATCO43716 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GATCO43716 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GATCO43716 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GATCO43716 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GATCO43716 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GATCO43716 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GATCO43716 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
GATCO43716 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GATCO43716 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GATCO43716 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
GATCO43716 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
GATCO43716 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
GATCO43716 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GATCO43716 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
GATCO43716 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms