Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VGLL3A8MV65 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VGLL3A8MV65 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VGLL3A8MV65 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VGLL3A8MV65 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VGLL3A8MV65 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VGLL3A8MV65 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VGLL3A8MV65 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VGLL3A8MV65 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VGLL3A8MV65 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VGLL3A8MV65 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VGLL3A8MV65 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VGLL3A8MV65 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VGLL3A8MV65 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VGLL3A8MV65 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
VGLL3A8MV65 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
VGLL3A8MV65 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VGLL3A8MV65 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VGLL3A8MV65 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VGLL3A8MV65 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VGLL3A8MV65 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
VGLL3A8MV65 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VGLL3A8MV65 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VGLL3A8MV65 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VGLL3A8MV65 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VGLL3A8MV65 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VGLL3A8MV65 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VGLL3A8MV65 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VGLL3A8MV65 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VGLL3A8MV65 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VGLL3A8MV65 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VGLL3A8MV65 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VGLL3A8MV65 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VGLL3A8MV65 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VGLL3A8MV65 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
VGLL3A8MV65 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VGLL3A8MV65 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VGLL3A8MV65 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VGLL3A8MV65 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VGLL3A8MV65 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VGLL3A8MV65 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VGLL3A8MV65 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VGLL3A8MV65 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
VGLL3A8MV65 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
VGLL3A8MV65 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VGLL3A8MV65 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
VGLL3A8MV65 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VGLL3A8MV65 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VGLL3A8MV65 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VGLL3A8MV65 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VGLL3A8MV65 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VGLL3A8MV65 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VGLL3A8MV65 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VGLL3A8MV65 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VGLL3A8MV65 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VGLL3A8MV65 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VGLL3A8MV65 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VGLL3A8MV65 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VGLL3A8MV65 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VGLL3A8MV65 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VGLL3A8MV65 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VGLL3A8MV65 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VGLL3A8MV65 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
VGLL3A8MV65 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VGLL3A8MV65 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VGLL3A8MV65 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
VGLL3A8MV65 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VGLL3A8MV65 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VGLL3A8MV65 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VGLL3A8MV65 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VGLL3A8MV65 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VGLL3A8MV65 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VGLL3A8MV65 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VGLL3A8MV65 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VGLL3A8MV65 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VGLL3A8MV65 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VGLL3A8MV65 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VGLL3A8MV65 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VGLL3A8MV65 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VGLL3A8MV65 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VGLL3A8MV65 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VGLL3A8MV65 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VGLL3A8MV65 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VGLL3A8MV65 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VGLL3A8MV65 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VGLL3A8MV65 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VGLL3A8MV65 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
VGLL3A8MV65 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VGLL3A8MV65 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VGLL3A8MV65 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VGLL3A8MV65 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VGLL3A8MV65 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VGLL3A8MV65 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VGLL3A8MV65 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VGLL3A8MV65 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VGLL3A8MV65 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VGLL3A8MV65 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VGLL3A8MV65 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VGLL3A8MV65 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VGLL3A8MV65 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms